В кампанию 1912 года лодки Дивизиона Подплава совершали переходы в Алупку, в Балаклаву, Ялту и Евпаторию, участвовали в учениях Черноморского флота, особенностью которых было обнаружение подводных лодок аэропланами. Идущая в надводном положении подводная лодка «Судак» была сразу обнаружена с воздуха, шедшая под перископом лодка «Карп» была обнаружена аэропланом по оставляемому перископом буруну, и только лодка «Лосось», лежавшая на грунте на глубине 45 футов, осталась незамеченной.
9 августа 1912 года Дивизион принял участие в императорском смотре Черноморского флота, по результатам которого Николай II поблагодарил команды и «изъявил монаршее благоволение» командиру Дивизиона и командирам подводных лодок. В этом же году приняли решение красить подводные лодки в темно-шаровый цвет. Позже, в 1915 году подводные лодки 1-го дивизиона имели на рубках опознавательные марки в виде полос белого цвета, позже замененные изображениями Андреевского флага. Но эти флаги как демаскирующие вскоре закрасили. На лодках нанесли опознавательные марки в виде видимых с воздуха двух полос белого цвета, нанесенных перпендикулярно диаметральной плоскости.
В апреле 1914 года командование флота выделило Дивизион подводных лодок в самостоятельную войсковую часть, ставшую Отдельным Дивизионом подводных лодок. 10 сентября этого же года на основании приказа по флоту № 49 сформировали Бригаду подводных лодок в составе двух дивизионов. Штатно-должностное расписание Подводных Сил флота включало перечень должностей, соответствующий чин, предельный возраст пребывания в чине и условия выдвижения на данную должность (ценз). Так, должность начальника Бригады подводных лодок соответствовала чину контр-адмирал, предельный возраст – пятьдесят шесть лет, назначение могло состояться при условии командования кандидатом дивизионом подводных лодок II ранга или надводным кораблем I ранга. Командующий Черноморским флотом назначил начальником Бригады Черноморского Подплава капитана 2-го ранга Вячеслава Евгеньевича Клочковского.
Должность начальника дивизиона подводных лодок II ранга соответствовала чину капитана 1-го ранга, предельный возраст – пятьдесят три года, при наличии опыта командования подводной лодкой II ранга или командования надводным кораблем II ранга.
Должность командира подводной лодки II ранга соответствовала званию капитана 2-го ранга, предельный возраст до пятидесяти лет, при условии командования подводной лодкой III ранга не менее двух лет или службы старшим офицером подводной лодки II ранга не менее двух лет.
Должность старшего офицера подводной лодки II ранга соответствовала чину старшего лейтенанта, предельный возраст составлял сорок пять лет. Занимать должность мог офицер Подплава с двухлетним и более стажем службы на подводных лодках.
Должность вахтенного начальника подводной лодки, специалиста подводной лодки соответствовала чину лейтенант, при предельном возрасте пребывания в чине сорок лет. Ее могли занимать флотские офицеры, служившие на надводных кораблях II–III ранга и окончившие Офицерский класс Подводного плавания, или специалисты, окончившие соответствующий класс офицеров – специалистов флота.
Как следует из «Списка личного состава судов флота, строевых и административных учреждений морского ведомства» на октябрь 1914 года в Отдельный Дивизион подводных лодок включал подводные лодки III ранга: «Карп» под командованием лейтенанта Беляева, «Карась» – командир лейтенант Паруцкий, «Лосось» – командир лейтенант Дудкин 2-й, «Судак» – лейтенант Зарубин.
Боевые действия на Черноморском театре в Первую мировую войну начались 16 октября 1914 года. К этому времени на флоте успели создать школу подготовки подводников, сформировали систему регулярной учебной и боевой подготовки Подводных сил. Используя железную дорогу, военно-морской флот выполнил межтеатровый маневр, доставив подводные лодки из Балтики в Севастополь, создав тем самым основу Подводных сил Черноморского флота, а проведенные маневры показали готовность подводных лодок к обороне прибрежных вод России в Черном море.
К началу войны новые мореходные подводные лодки для Черноморского флота все еще находились в достройке, хотя работы велись круглосуточно. По вступлению в строй в декабре 1914 года первой мореходной подводной лодки «Нерпа», а в марте-апреле 1915 года второй и третьей однотипных ей лодок «Морж» и «Тюлень» их свели в 1-й дивизион Бригады Подводного плавания, который моряки-черноморцы в шутку окрестили «ластоногий дивизион». Весной 1915 года командиру Бригады Черноморского Подплава В.Е. Клочковскому присвоили звание капитана 1-го ранга.
Вячеслав Евгеньевич Клочковский участвовал в походе 2-й эскадры флота Тихого океана и в Цусимском бою 14–15 мая 1904 года. После гибели крейсера «Адмирал Нахимов» попал в японский плен. По возвращению из плена в ноябре 1905 года назначен старшим штурманским офицером крейсера «Богатырь», а затем и крейсера «Диана».