Макклой создал официальный совет по рассмотрению приговоров военным преступникам - Консультативный совет по вопросам помилования военных преступников, известный как Peck Panel , по имени его председателя Дэвида В. Пека. Влиятельный бывший нацистский генерал-лейтенант Ганс Шпейдель лично обратился к Макклою. Шпейдель был одним из главных советников канцлера Конрада Аденауэра по вопросам перевооружения - весьма спорной теме, но тем не менее обсуждаемой. Младший брат Ганса Шпайделя, Вильгельм Шпайдель, был осужден в Ландсберге как военный преступник. Шпейдель сказал адъюнкту Макклоя в Бонне , "[Если] заключенные в Ландсберге будут повешены, то Германия как вооруженный союзник против Востока станет иллюзией". Канцлер Конрад Аденауэр в столь же агрессивной манере сказал Макклою то же самое, посоветовав ему предоставить " максимально возможное помилование для лиц, приговоренных к тюремному заключению".
В июне 1950 г. северокорейские войска, поддерживаемые коммунистами, перешли 38-ю параллель, что ознаменовало начало Корейской войны. В Пентагоне зародилась мысль о том, что коммунисты собираются вторгнуться и в Западную Европу. 14 июля 1950 года командующий авиабазой Райт-Паттерсон направил штатному руководителю операции Paperclip полковнику Дональду Путту срочную служебную записку: " В связи с угрозой надвигающихся военных действий в Европе и возможностью быстрого захвата континента силами СССР данное командование озабочено проблемой немедленной реализации программы эвакуации немецких и австрийских ученых". Если бы эти ученые "попали в руки врага... они представляли бы угрозу нашей национальной безопасности". Разведка ВВС рекомендовала JIOA начать "массовые закупки" в Германии. JIOA согласился и начал разрабатывать официальные планы с офисом Верховного комиссара, чтобы осуществить это.
Корейская война вызвала новый пожар в рамках операции "Скрепка". В аппарате Верховного комиссара Макклой держал группу под названием "Отдел научных исследований", которая специально занималась проблемой немецких ученых. Руководителем отдела был доктор Карл Нордстром, и с момента вступления Макклоя в должность Нордстром пытался ускорить процесс переезда немецких ученых в Америку. Доктор Нордстром вел толстую папку с надписью "Распределение немецких ученых и техников" и неоднократно направлял Макклою записки "в поддержку определенных исследовательских проектов", которые, по его мнению, представляли ценность для национальных интересов. Теперь, в свете корейской войны, Нордстром получил новое задание от JIOA. Он был назначен немецким связным в новой программе JIOA, которая быстро продвигалась из Пентагона и называлась Accelerated Paperclip, но на местах именовалась Project 63: Многие немцы не одобряли название Paperclip. Суть программы "Ускоренный Paperclip" заключалась в том, чтобы вывезти из Германии " особо опасных ученых высшего уровня " в рамках "модифицированной программы отказа", которую необходимо было любой ценой держать подальше от Советов. Верховный комиссар начал сотрудничать с армейской разведкой с целью "эвакуации" 150 таких ученых, получивших кодовое название "список К", из Германии в США. Для вербовки ученых из списка "К" должна была быть направлена группа американских офицеров под названием "Группа специальных проектов". Объединенный комитет начальников штабов утвердил огромный бюджет на закупки в размере 1 млн. долл. для привлечения этих "особо опасных ученых высшего уровня" в Америку, что эквивалентно примерно 10 млн. долл. в 2013 году.