Гиммлер был увлечен биологической войной как дилетант. Бывший птицевод, рейхсфюрер СС изучал сельское хозяйство в школе. По мнению Блома, именно Гиммлер был главным мотиватором программы создания биооружия в Рейхе. Гитлер, по словам Блома, не одобрял биологическую войну, и его держали в неведении относительно конкретных планов . По словам Блома, Гиммлера больше всего интересовала бубонная чума.
30 апреля 1943 года Геринг учредил должность специалиста по изучению рака, которую должен был занять Бломе. В течение следующих девятнадцати месяцев, пояснил Бломе, он пять раз встречался с Гиммлером.
На первой встрече, которая состоялась летом 1943 г. - Бломе вспоминал, что это было в июле или августе, - Гиммлер поручил Бломе изучить различные способы распространения чумных бактерий для наступательной войны. По словам Бломе, он поделился с Гиммлером своими опасениями относительно опасного эффекта бумеранга, который, скорее всего, окажет на Германию бомба с чумой. Гиммлер сказал Бломе, что в таком случае он должен немедленно приступить к работе по созданию вакцины, которая предотвратит подобное развитие событий. По словам Бломе, чтобы ускорить процесс создания вакцины, Гиммлер приказал ему "использовать человеческие существа".
Гиммлер предложил Бломе медицинский блок в концлагере типа Дахау, где он мог бы завершить эту работу. По словам Блома, он сказал Гиммлеру, что ему известно о "серьезных возражениях в определенных кругах" против использования людей в экспериментальных испытаниях вакцин. Гиммлер ответил Бломе, что эксперименты на людях необходимы для ведения военных действий. Отказ был "равносилен измене".
Очень хорошо, сказал Бломе. Он считал себя верным нацистом, и в его намерения входило помочь Германии выиграть войну. " История дает нам примеры того, как болезни людей влияют на исход войн", - сказал Бломе своим дознавателям из Alsos, улучив момент, чтобы прочитать им лекцию по истории. "Мы знаем, что начиная с античности и вплоть до наполеоновских войн победы и поражения часто определялись эпидемиями и голодом, - сказал Бломе. Распространение инфекционного заболевания может привести к гибели армии мародеров, и, по словам Блома, провал русской кампании Наполеона "во многом объясняется заражением его лошадей гландами" - высококонтагиозным бактериальным заболеванием. По словам Блома, он консультировал Гиммлера по поводу того, что концентрационный лагерь - ужасное место для экспериментов с бубонной чумой, поскольку население там слишком плотное.
Бломе сказал Гиммлеру, что для экспериментов с чумной бактерией ему нужен собственный институт, изолированное учреждение, удаленное от населенных пунктов. Гиммлер и Бломе согласились, что Польша будет подходящим местом, и остановились на Нессельштедте , небольшом городке возле бывшего Познаньского университета (к тому времени находившегося в ведении Рейха). Исследовательский институт Бломе должен был называться Бактериологическим институтом в Нессельштедте.
В это время в Берлине Бломе руководил полевыми испытаниями с использованием крыс - традиционных переносчиков бубонной чумы. В Институте гигиены Ваффен-СС велись дебаты о том, являются ли крысы лучшими переносчиками чумы. Идея Гиммлера заключалась в том, чтобы "взять зараженных крыс на подводные лодки и выпустить их у вражеских берегов, чтобы они могли доплыть до суши". Бломе сомневался, что крысы способны проплыть большое расстояние. Он считал, что они могут плавать только до тех пор, пока воздух в их шерсти поддерживает их на плаву. Чтобы доказать свою точку зрения, Бломе организовал испытание на берлинском озере. "Около тридцати крыс вывезли на полицейской лодке и выпустили на разных расстояниях от берега, чтобы они плыли как по ветру, так и против ветра". По словам Бломе, крысы оказались глупее, чем он думал, - когда их поместили в воду, "они не знали, где находится берег, и плавали в разных направлениях". Несколько крыс утонули за 10 минут. Дольше всего крысы плавали - тридцать минут. Из тех, кого выпустили на расстоянии чуть более полумили от берега, только треть достигла суши. По мнению Блома, идея Гиммлера о рассеивании крыс на лодках была непрактичной.
Встреча номер два состоялась через месяц или два, в сентябре или октябре 1943 г., и была в основном повторением первой, по крайней мере, по словам Блома. Однако было одно существенное событие. Гиммлер спросил Блома, не нужен ли ему помощник. Бломе согласился, что бактериолог был бы полезен. Гиммлер назначил на д-ра Карла Гросса, ранее работавшего в Институте гигиены Ваффен-СС.
Эти два врача не ладили друг с другом. Бломе был убежден, что доктор Гросс был подослан Гиммлером, чтобы шпионить за ним. Он сказал своим следователям , что на него оказывалось сильное давление, чтобы он работал быстрее. Гиммлер неоднократно "повторял, что методы ведения БВ [биологической войны] должны быть изучены для того, чтобы понять, как от нее защититься". Это означало, что Гиммлер хотел, чтобы Бломе заразил подопытных людей чумой, чтобы посмотреть, что с ними произойдет.