Отношения Верховного лидера с другими духовными лицами можно разделить на три направления: отношения с другими Великими аятоллами и аятоллами вне правительства; отношения с теми духовными лицами, которые занимают важнейшие посты в правительстве; отношения с теми духовными лицами, которые выбирают нового Верховного лидера. Отношения Верховного лидера с высокопоставленным духовенством, не входящим в правительство, конституция оставляет более или менее нетронутыми. Согласно шиитским традициям и обычаям, Верховный лидер может быть первым среди равных вне правительства, но может и не быть. Клерикальная иерархия полицефальна, и каждый Великий аятолла в значительной степени независим и автономен от других. Несмотря на то, что конституция формирует политическую практику, которая влияет на организацию и деятельность шиитского духовенства вне правительства, она не допускает формального вмешательства государства в отбор лидеров духовенства, работу богословских школ, штата мечетей, научные труды и постановления, выносимые священнослужителями. Хотя было бы слишком упрощенно говорить о том, что духовенство вселилось в правительство, но не наоборот. Верховный лидер обладает не большей властью над клерикальным сообществом за пределами правительства, чем престиж, заработанный им благодаря учености и благочестию.
Совсем иная ситуация складывается в отношениях Верховного лидера с духовенством, получающим должности в правительстве. Многие из этих должностей зарезервированы за священнослужителями, и каждый пост может быть занят священнослужителем. Практически все эти назначения производятся Верховным лидером прямо или косвенно (через назначаемые им органы). Поскольку Совет стражей определяет, кто может быть избран в Меджлис, Верховный лидер может не допустить клирика и туда. Во всех этих отношениях в Исламской Республике существует очень жесткая иерархия духовенства, которая существенно отличается от структуры традиционного клерикального сообщества вне правительства. Верховный лидер может навязывать ортодоксию в правительстве, которая была бы недоступна ему в остальном обществе.
Поскольку Верховный лидер смертен, конституция предусматривает выбор его замены. Не будет никаких сложностей, если, как в случае с Хомейни, иранский народ определит преемника путем аккламации. Однако если этого не произойдет
Эксперты, избранные народом, рассматривают и консультируются между собой относительно всех лиц, которые могут претендовать на роль марджи и лидера. Если они обнаружат в каком-либо мардже выдающиеся способности к руководству, то представят его народу в качестве лидера; если нет, то назначат трех или пять марджей, обладающих необходимыми качествами для руководства, и представят их в качестве членов Совета лидеров.
Эти "эксперты" должны быть представителями духовенства. Только те, чьи кандидатуры одобрены Советом стражей и Верховным лидером, могут быть выбраны "народом" на выборах. В этом и других отношениях народное волеизъявление сильно ограничено. После своего формирования Ассамблея экспертов (она носит то же название, что и конституционный съезд) может изменить порядок отбора "экспертов". Таким образом, если Верховный лидер еще жив, то он будет играть очень большую и, возможно, определяющую роль в выборе своего преемника. Но сам преемник не в состоянии повлиять на его выбор. Роль народа, в соответствии с идеологическим обоснованием клерикального правления, во многом сводится к тому, что он готов делегировать выбор нового Верховного лидера "экспертам", которые лучше понимают исламское право и находятся в более выгодном положении.
Однако, если ни один человек не подходит для работы в одиночку, "эксперты" могут выбрать несколько священнослужителей для совместной работы в качестве "Руководящего совета".
Выборы "экспертов" для выбора нового Верховного лидера - один из нескольких случаев, когда конституция предусматривает всенародные выборы. Все они подробно описаны в статье 6:
В Исламской Республике Иран управление делами страны должно осуществляться на основе общественного мнения, выраженного путем выборов, включая выборы Президента Республики, представителей Национального консультативного собрания [Меджлиса] и членов советов, или путем референдумов по вопросам, указанным в других статьях настоящей Конституции.
Однако правомочность кандидатов настолько жестко контролируется либо Верховным лидером, либо органами, в которых доминируют его назначенцы, что "общественное мнение" может быть выражено только в достаточно узком диапазоне альтернатив. В этом диапазоне может происходить и происходит острая политическая конкуренция, но конституция очищает волю народа, ограничивая диапазон альтернатив до начала этой конкуренции. После такой очистки воля народа может быть адекватно и продуктивно выражена.