Предлагалось главный удар нанести силами 12-й армии из района севернее Черновиц в направлении на Сирет. Далее одна группировка войск должна была наступать на Дорохой, Костешты и вдоль Прута на Яссы, а другая — на Сучаву и вдоль р. Сирет на Роман, Бакэу, Мэрэшешты, Галац, Брэилу и Измаил. Уже к исходу первого дня операции механизированные части должны были занять Дорохой, к исходу второго дня — Андриешени и к исходу 3-го дня — Яссы и Хуши. Войска 5-й армии должны были наступать от Студеницы на фронт Бричаны — Липканы и далее на Бельцы. 9-я армия своим 35-м стрелковым корпусом должна была наступать на Кишинев и далее на Хуши. 30-й стрелковой дивизии следовало форсировать Днестровский лиман и наступать на Аккерман, Сарата, а 150-ю дивизию планировалось перевести из Крыма на кораблях Черноморского флота и высадить в районе Жебриян.
В дальнейших вариантах плана происходило увеличение привлекаемых к операции войск и сокращение стоящих перед ними задач. Так, в состав 9-й армии было введено управление 55-го стрелкового корпуса, а морской десант у Жебриян следовало подготовить из частей 74-й стрелковой дивизии, развертываемой в районе Одессы. На Черноморский флот первоначально планировалось возложить следующие задачи:
«а) Организовать непрерывную и надежную дозорную службу подводными лодками, авиацией и легкими силами в Черном море у Босфора и быть готовыми быстро поставить минные заграждения у Босфора;
б) Уничтожить румынский военный и морской флот как в плавании, так и в военных базах;
в) Блокировать все побережье и порты Румынии (Констанца и другие);
г) В первый же день прочно закрыть Дунайское гирло от возможных попыток прохода по Дунаю вооруженных судов Румынии;
д) Оказать помощь и содействие войскам 9 армии при форсировании р. Днестр через косу в Днестровском лимане;
е) Организовать перевозку и высадку десанта 74 стр. дивизии из Одессы в район Жебрияны».
13 июня с 13.20 до 14.30 часов в Кремле состоялось совещание высшего военно-политического руководства, на котором присутствовали И. В. Сталин, В. М. Молотов, нарком обороны маршал С. К. Тимошенко, начальник Генштаба маршал Б. М. Шапошников, его заместитель генерал-лейтенант И. В. Смородинов, начальник Политуправления РККА армейский комиссар 1 ранга Л. З. Мехлис, командующие войсками и члены Военных советов КОВО — генерал армии Г. К. Жуков, корпусной комиссар В. Н. Борисов и ОдВО — генерал-лейтенант И. В. Болдин и корпусной комиссар А. Ф. Колобяков, нарком ВМФ адмирал Н. Г. Кузнецов, начальник Главного морского штаба адмирал Л. М. Галлер и командующий Черноморским флотом контр-адмирал Ф. С. Октябрьский.[324]
К сожалению, материалы этого совещания все еще секретны, однако совершенно очевидно, что речь на нем шла о подготовке операции против Румынии. В частности, руководство ВМФ настояло на резком сокращении задач для Черноморского флота, и этот раздел плана был подготовлен лично Галлером.[325] Морской десант у Жебриян было решено не проводить (эта идея была реализована 24 августа 1944 г. в ходе Ясско-Кишиневской операции). Кроме того, был решен вопрос о создании оперативного объединения Черноморского флота на реке Дунай — Дунайской военной флотилии, создание которой началось четыре дня спустя.Результатом всей этой работы стала директива наркома обороны и начальника Генштаба № 101396/сс, которую прибывшие на самолете из Москвы подполковник Шикин и майор Рыжаев в 21.45 20 июня 1940 г. вручили командующему войсками КОВО генералу армии Г. К. Жукову.
«Приказываю:
1. Приступить к сосредоточению войск и быть готовым к 22 часам 24 июня к решительному наступлению с целью разгромить румынскую армию и занять Бессарабию.
2. При сосредоточении иметь следующую группировку:
а) 12 армия — командующий армией генерал-лейтенант тов. Черевиченко, зам. командующего — генерал-лейтенант тов. Парусинов.
Штаб армии — Коломыя.
Войска армии развернуть: управления 13, 8, 17 стрелковых корпусов; 139, 60, 62, 124, 72, 58, 146, 131 и 81 стрелковые дивизии; 5, 10, 23, 24, 26 и 38 танковые бригады; 135, 168, 305, 324, 375 и 376 артполки РГК; 315 и 316 артдивизионы в районе Куты, Снятынь, Стецова, Коломыя.
Управление 15 стрелкового корпуса, 7 и 141 стрелковые дивизии, 120 артполк РГК в районе Городенка, Филипковцы, Новосюлка-Костюкова.
Управления 2 и 4 кавалерийских корпусов, 3, 5, 16 и 34 кав. дивизии в районе Яблонув, Гвозьдзец, Подгайчики, Коломыя.
192 стрелковая дивизия в районе — Усьцерыки, Полянки, Кишворувня.
Авиация армии — пять полков СБ, два полка легкобомбардировочных и восемь истребительных полков.
Разграничительная линия между 12 и 5 армиями: река Збруч, Хотин, Липканы, все пункты включительно для 12 армии.
б) 5 армия — командующий армией генерал-лейтенант тов. Герасименко, зам. командующего — генерал-майор тов. Советников.
Штаб — Дунаевцы.
Войска армии развернуть:
Управление 49 стрелкового корпуса, 80, 44 и 135 стрелковые дивизии; 36 и 49 танковые бригады, 137 и 331 артполки и 34 артдивизион РГК в районе — Баговица, Студеница, Ст. Ушица, Крушановка.