Умение расположить к себе людей разных национальностей, привить и углубить интерес к Православию определил назначение Тихона в 1898 г. в далекую Американскую епархию в сане епископа Алеутского. Девять лет он осуществлял епископское служение в Северной Америке. Он преобразовал Миссионерскую школу в Миннеаполисе в Духовную семинарию. Кафедра епископа Алеутского Тихона находилась в Сан-Франциско, а новые переселенцы в Северную Америку поселялись в основном в восточных штатах. Вот почему кафедра епископа была перенесена по его настоянию в Нью-Йорк. При его постоянном внимании открывались новые православные храмы. Епископ Тихон много сил и времени отдавал переводу на английский язык православной богослужебной литературы. В 1905 г. он был возведен в сан архиепископа Алеутского и Североамериканского. В 1907 г. по его инициативе был созван первый Православный собор Североамериканской Церкви, который состоялся в Майнфильде. На Соборе рассматривался и вопрос о юридическом статусе Православной Церкви в Америке. (В те годы Святейший Синод России не был готов дать ответ на этот вопрос; только 60 лет спустя в 1967 г. Православная Церковь в Америке получила самостоятельность, а святитель Тихон понимал это еще в начале ХХ в.).
Затем святителя Тихона отозвали в Россию, где он управлял Ярославской епархией, был архиепископом Ярославским и Ростовским. Ярославское светское общество избрало его почетным гражданином Ярославля. Владыка Тихон служил в Ярославской епархии с 1907 г. по 1913 г., он отстаивал вопросы церковной свободы, что не всегда устраивало государственную власть. Именно из-за конфликта епископа Тихона с ярославским губернатором 49-летнего святителя перевели в Литву, на литовскую кафедру (именно губернатор добился перевода неудобного для него архиерея).
Приехав в Вильно в 1914 г., владыка Тихон сделал очень много пожертвований в различные благотворительные учреждения. Это было не совсем обычным в литовском крае, где высоко ценили роскошь, пышность и в меньшей мере уделяли внимание благотворительной деятельности. Владыка Тихон не отступал от подобающего церковного великолепия на службах, в своей жизни оставался добрым и скромным человеком, в равной мере уважительно относился к людям разных национальностей.
Святительское служение в Литве было прервано начавшейся в 1914 г. Первой мировой войной. Архиепископу Тихону пришлось покинуть епархию в Литве. Вначале он поселился в Москве, а затем в Дисне, на окраине Литовской епархии.