Военные в своем большинстве категорически отвергали капитуляцию. Обе группы сходились в одном — сопротивляться советским войскам до конца, что обусловило ведение боевых действий против Красной Армии даже после получения приказа японского императора о безоговорочной капитуляции 14 августа. Само японское правительство пыталось в этот период времени вести сепаратные переговоры с американцами, которые отвергли это предложение. С другой стороны, невозможно пройти мимо того факта, что штабы генерала Макартура и адмирала Нимица постоянно вводили в заблуждение советское главнокомандование на Дальнем Востоке, предоставляя информацию о выставленных минных заграждениях вблизи главных портов и морских коммуникаций, используемых японской армией и ВМФ на Дальнем Востоке. Обобщение этих данных выявило тот примечательный факт, что американские мины были везде, где действовал или должен был действовать советский флот. Напротив, морских мин союзников не было там, где хотя бы временно действовали американские ВМС или где была американская зона оккупации. В результате на минных полях, выставленных американской авиацией, подорвалось несколько советских военных кораблей и транспортов.
12 августа все командующие японскими войсками на местах получили телеграмму с требованием продолжать вооруженную борьбу, т. е. после двух атомных взрывов. Телеграмма была подписана военным министром Анами и начальником штаба армии генералом Умэдзу. Только военно-морской министр адмирал Ёнаи, евразиец и сторонник дружественных отношений с Россией, выступил против продолжения войны и участия в мятеже 14 августа. Он способствовал воздействию на императора по принятию условий безоговорочной капитуляции. Более того, адмирал Ёнаи предложил правительству обратиться к посредничеству СССР для обеспечения этого плана завершения войны. Начальник главного морского штаба адмирал Тоеда также присоединился к сторонникам продолжения войны. Все они заявили правительству, что условия капитуляции для них неприемлемы.
Дискуссия продолжалась на следующий день, когда «крестный отец» корпуса камикадзе адмирал Ониси заявил военным и министру иностранных дел Того, что необходимо предложить императору проект указа об использовании в войне 20 млн камикадзе. Того сразу покинул совещание, сказав, что император уже высказался в узком кругу за принятие условий капитуляции.
Весть в Токио о подписании императором указа об окончании войны (пока без его обнародования) вызвала военный мятеж, а мятежники захватили императорский дворец, при этом погиб командир охраняющей микадо гвардейской дивизии генерал Мори. Мятежники также обыскали дворец в поисках записанного на граммофонную пластинку заявления микадо о безоговорочной капитуляции Японии в войне, но не нашли ее. Они, пользуясь ночным временем, совершили налеты на дома своих политических противников в правительстве — премьера Хиранумы, председателя Тайного совета при императоре Хара и других государственных деятелей. Многие из них в поисках спасения своей жизни испытали многие неприятности; так, Хиранума просидел всю ночь в выгребной яме.
К концу ночи с 14 на 15 августа Анами и Умэдзу убедились, что командующие и войска не поддержали их действий, в том числе командующий Восточным (столичным) военным округом генерал Танака. Более того, Танака лично направился в императорский дворец, чтобы освободить его от заговорщиков. После получения этого уведомления генерал Анами совершил священный обряд сэппуку, сделав себе харакири. Несколько десятков офицеров-заговорщиков также сделали харакири, после того как Танака объявил несогласным об указе императора.
В 8 часов утра 15 августа мятеж самураев был подавлен; императорская гвардия в подавляющем большинстве осталась в своих казармах. В 12 часов по токийскому времени император Хирохито обратился к нации и миру с обнародованием своего рескрипта о безоговорочной капитуляции. Диктор столичного радио заранее предупредил, что речь микадо передается в записи.
В тот же день, после заслушивания императорского указа, совершили харакири маршал Сугияма, бывший командующий Квантунской армией генерал С. Хондзе, командующий 10-м фронтом генерал Р. Андо, адмирал Ониси, другие командующие. Неудачно пытался застрелиться бывший премьер-министр Тодзио, вскоре осужденный Токийским трибуналом к высшей мере наказания.
Многие из генералов и офицеров японской авиации пошли в этот день на «специальную атаку» американских военных кораблей. Так, когда адмирал Угаки, авиационный генерал в Китае, приказал подготовить к полету три бомбардировщика, то он увидел, что к нему присоединилось еще 8 экипажей. Все одиннадцать боеспособных экипажей — 22 летчика — пошли на таран американских кораблей, выполнив добровольно взятую обязанность стать «камикадзе». Это были экипажи всех исправных самолетов.