Джамгон Конгтрул включил в программу своего ретрита все основные практики традиции шангпа кагью, так как являлся основным держателем этой линии в своё время. Большинство из этих практик произошли от индийской дакини Нигумы, которая получила их персонально от Будды Ваджрадхары и передала прославленному тибетскому мастеру Кхьюнгпо Налджору (978-1127), чьим воплощением считают Джамгона Конгтрула. Меньшая часть практик происходит от другой индийской дакини – Сукхасиддхи, ученицы маха-сиддхи Вирупы, также получившей свою линию от Будды Ваджрадхары на нематериальном плане. Уникальность линии шангпа кагью состоит в том, что она произошла от двух просветлённых женщин, что не имеет прецедентов ни в одной духовной традиции буддизма или других религий.
Стадия порождения, составляющая основу этих медитаций, посвящена практикам Чак-расамвары и божествам пяти [классов] тантры, которые объединены в одной мандале. Эти пять божеств воплощают пять аспектов тантрической практики. Джамгон Конгтрул пояснил это в своей «Энциклопедии буддизма
»:«Хеваджра – это божественное проявление внутреннего жара туммо. Чакрасамвара является выражением карма-мудры (т. е. сексуальной йоги). Божественное проявление иллюзорного тела и ясного света – это Гухьясамаджа. Махамая – это проявление практики сновидений. Выражение просветлённой активности проявлено в Ваджрабхайраве. Кхьюнгпо Налджор продемонстрировал эти пять божеств в пяти местах своего собственного тела».
Следом за практикой этих божеств идёт медитация стадии завершения «Пяти золотых учений». Эти пять учений схематически и метафорически уподоблены форме дерева. Корнями этого дерева являются Шесть йог Нигумы, включающие практики внутреннего жара (тиб. туммо), иллюзорного тела (тиб. гью лю), йоги сновидений (тиб. ми лам), ясного света (тиб. о сэл), переноса сознания (тиб. пхова) и посмертного состояния (тиб. бард о). Эти Шесть йог Нигумы практически ничем не отличаются от более известных Шести йог Наропы, которому Нигума приходилась супругой. Ствол дерева, произрастающего из этих корней, – это медитация маха-мудры, которая практикуется в соответствии с наставлениями Нигумы «Махамудра из амулета». Ветвями дерева «Пяти золотых учений
» являются «Три медитации в действии», включающие практики гуру, йидама и иллюзорного тела. Практики Белой и Красной Дакинь являются «цветами» этого дерева. Плод дерева заключается в практиках «Бессмертия» и «Невозвращения [в сансару и нирвану]».