Как известно, после смерти Сталина развернулась борьба за власть среди членов нового «коллективного руководства», в ходе которой Берия Л. П. был арестован, а вместе с ним в опале оказалось и всё его окружение. В поле зрения развернувшегося следствия автоматически попали практически все друзья и сослуживцы Берии Л. П., все те, кто длительное время работал с ним в чекистском аппарате. В число непосредственных «заговорщиков» Фитина П. М., к счастью, не включили, но в то же время бывший начальник разведки оказался в кругу близких людей опального министра внутренних дел. Все назначения и награды Фитина П. М. утверждались распоряжениями Берия Л. П., и новые руководители органов госбезопасности расценили это как благосклонное расположение «лубянского маршала» к своему подчиненному.
Вскоре после ареста Берия Л. П. 16 июля 1953 г. Фитина П. М. освободили от занимаемой должности начальника крупнейшего чекистского управления на Урале, а спустя четыре месяца, в ноябре 1953 г., уволили в запас МВД-МГБ СССР «по служебному несоответствию». Следует, кстати, признать: Фитину П. М. повезло куда больше, чем другим сотрудникам и руководителям внешней разведки: его не расстреляли, как Деканозова В. Г. и братьев Богдана и Амаяка Кобуловых; не посадили в тюрьму, как Судоплатова П. А. и Эйтингона Н. И.; он не умер на допросе в Лефортово, как Серебрянский Я. И. Судьбу Фитина П. М. разделили многие видные чекисты-разведчики. Так, Рыбкина З. И. (Воскресенская), также не имевшая положенной для пенсии выслуги лет, поехала «дослуживать» в Воркутинский ИТЛ. Из органов госбезопасности были «вычищены» по сокращению кадров Модржинская Е. Д., Гудимович П. И., Семенов С. М.
Кроме Фитина П. М. в опалу попали еще 63 бывших ответственных работника органов госбезопасности, которые были лишены генеральских званий и уволены со службы, некоторые из них были отданы под суд и осуждены. На периферии развернулась настоящая «охота на ведьм». Более 3000 офицеров госбезопасности были уволены «как не пригодные и не способные в новых условиях обеспечивать выполнение возложенных на них обязанностей» или «по служебному несоответствию» [8, С. 233–234]. Многие уволенные чекисты остались без средств к существованию, поскольку им не назначались пенсии. Большинство начальников управлений в центральном аппарате и на местах после ареста министра МВД маршала Берия Л. П. были заменены в течение 2–3 месяцев. Клеймо «бериевца» ложилось на десятки генералов и сотни офицеров органов госбезопасности. Чистка и сокращение спецслужб после 1953 г. проходили под знаком борьбы с «бандой Берия» якобы за восстановление руководящей линии партии в органах госбезопасности. Некоторые просто не выдерживали такой травли и пускали себе пулю в висок, как это сделал в апреле 1954 г. бывший заместитель министра внутренних дел СССР, Герой Советского Союза генерал армии Масленников И. И. или бывший начальник Главного управления шоссейных дорог НКВД-МВД СССР генерал-полковник Павлов К. А.
Громкие судебные дела, связанные с руководителями органов госбезопасности, вычеркнули из истории их заслуги перед страной в предшествующие годы. Руководители советских спецслужб, которые возглавляли советскую разведку и контрразведку в 1940-1950-е гг., стали объектами огульных обвинений в предательстве и измене, их превратили в главных виновников репрессий.
Только с появлением новых тенденций в новейшей историографии в 1990-е годы стала появляться информация о начальнике внешней разведки Фитине П. М. Но странным образом причины его увольнения из органов безопасности трактовались совершенно в ином ключе, чем это было на самом деле. Якобы в 1951 г. Берия Л. П. распорядился уволить Фитина П. М. из органов госбезопасности «по неполному служебному соответствию» без военной пенсии, так как генерал из разведки был ему неугоден. Миф о «кровавом интригане» Берии Л. П. и «жертве его произвола» Фитине П. М. пошел кочевать из статьи в статью [1, С. 5]. Теперь уже в рубрике «Даты и события», которая ведется в газете «Новости разведки и контрразведки», в заметке, посвященной 100-летию со дня рождения Фитина П. М., мы опять читаем: «После войны Берия рассчитался со строптивым начальником разведки, который оказался прав в отношении сроков нападения Германии на СССР. Лишь после ареста и суда над Берией и его подручными в 1953 году П. М. Фитину удалось устроиться директором фотокомбината Союза советских обществ дружбы, где он проработал до конца жизни» [3, С. 138].