По рекомендации адмирала Джона Фишера, Джеллико произвели в директоры Департамента Морской артиллерии в 1905 году. На следующий год Джеллико произведен в командоры Ордена Королевы Виктории по случаю спуска на воду линкора «Дредноут» — первого линкора в мире. В марте того же года назначен королевским адъютантом.
В чине контр-адмирала, который не заставил себя ждать к 1907 году, активно продвигал постройку нового типа боевых кораблей. Линкоры подобные «Дредноуту» и линейные крейсера типа «Инвинсибл» проектировались и строились при его горячей поддержке. Поддержка же была весьма действенной, учитывая связи со времен службы в Казначействе. Джеллико выступал сторонником нововведений в области управления огнем. Например, системы управления огнем Фредерика Дрейера, как и его же таблицы орудийной стрельбы, получили практическое воплощение, благодаря Джеллико.
Активная двухлетняя деятельность в Адмиралтействе прекратилась в 1907 году, когда его назначили заместителем командующего Атлантическим флотом. Джеллико держал флаг на борту броненосца «Альбемарль». Тем же годом адмирал удостоился звания рыцаря-коммандора Ордена Королевы Виктории по случаю визита короля Эдуарда VII на базу флота в Соленте. Через год Джеллико — уже на посту Третьего лорда Адмиралтейства и Казначея Флота. К 1910 г. Джеллико произведен в командующие Атлантическим флотом. Вымпел флагмана взмыл над броненосцем «Принц Уэльский». Во время коронационных торжеств при вхождении на трон короля Георга V, Джеллико возвели в рыцари-коммандоры Ордена Бани. В 1911 г. Джеллико вице-адмирал, а в 1912-м — Второй Лорд Адмиралтейства.
Начало Великой войны Джеллико встретил на посту командующего Флотом Метрополии, где он сменил адмирала Джорджа Каллахана по прямому распоряжению Первого Лорда Адмиралтейства Уинстона Черчиля. Катастрофа при Дарданеллах принудили обоих лордов Адмиралтейства (гражданского и военного), Фишера и Черчилля, покинуть свои посты. Джеллико писал своему бывшему покровителю:
«Мы несем долг признательности перед вами за спасение флота от пребывания в должности мистера Черчилля, и я надеюсь, что никакой политик никогда более не узурпирует функций, превосходящих его понимание. Джон Рашуорт Джеллико».
В ноябре 1916 года Джеллико занял пост Первого Морского Лорда (Главнокомандующий ВМФ, в отличие от гражданского Первого Лорда Адмиралтейства). На этой должности адмирала ждали интриги и парламентские склоки более, чем собственно военные заботы. Адмирал оказался в оппозиции премьер министру Ллойд Джорджу и его кабинету. Недоброжелатели указывали на ошибочные мнения Джеллико касательно формирования морских конвоев и роли подводных лодок, которые тот считал важнейшим фактором войны. Ллойд Джордж собирался уволить Джеллико с поста уже в июле 1917 года, но не смог. Это означало возврат в Адмиралтейство Черчилля, чего невозможно было допустить из-за отрицательной реакции Консервативной партии.
Тем не менее, к 24 декабря 1917 года Джеллико вынужден был покинуть пост. Чтобы «подсластить пилюлю» ему даровали звучный титул: Джеллико, Виконт Скапа Флоу.
Джеллико получил высшее военно-морское звание Адмирала Флота. В 1920 году его фактически отправили в почетную отставку — генерал-губернатором Новой Зеландии. После возвращения в Англию, его произвели в графское достоинство и даровали титул виконта, таким образом, полное его титулование получилось впечатляющим, как и вся карьера: Джон Рашворт, 1-й граф Джеллико, Виконт Скапа Флоу, виконт Саутгемптонский, адмирал Флота Его Величества.
Награды:
Большой Крест Ордена Бани — 8 февраля 1915 года. Командорский крест Ордена Бани — 19 июня 1911 года. Кавалер Ордена Бани — 9 ноября 1900 года. Великобритания.
Орден Заслуг — 31 мая 1916 года. Великобритания.
Королевский Викторианский орден. Большой Крест — 17 июня 1916 года. Командорский крест — 3 августа 1907 года. Кавалер ордена 13 февраля 1906 года. Великобритания.
Медаль За отвагу на море. Великобритания.
«Медаль Египет». Великобритания.
Медаль за кампанию в Китае 1900 года. Великобритания.
Звезда 1914 г… Великобритания.
Британская военная медаль.
Медаль Победы. Великобритания.
Медаль Коронации Короля Георга V. Великобритания.
Юбилейная серебряная медаль короля Георга V. Великобритания.
«Звезда Хедива». Египет.
Орден Красного орла 2-го класса с мечами — апрель 1902 года. Пруссия.
Большой крест ордена Почетного легиона — 15 сентября 1916 года. Франция.
Большой крест ордена Леопольда I — 21 апреля 1917 года. Бельгия.
Военный крест 1914–1918 гг. — 21 апреля 1917 года. Бельгия.
Орден Святого Георгия 3-й степени. 24 июля 1916 года российский император Николай II высочайше повелел наградить его орденом св. Георгия 3-й степени. Награждение утверждено 5 июня 1917 года. Российская империя.
Большой крест военного ордена Савои — 11 августа 1917 года. Королевство Италия.
Орден Восходящего Солнца с цветами Павловнии — 29 августа 1917 года. Японская империя.
Военный крест 1914–1918 гг. — 21 февраля 1919 года. Франция.
Медаль «За выдающуюся службу». — 16 сентября 1919 года. ВМС США.