Подрядчики обязались не только перестроить Никольский храм, но и перенести на юго-восток крепостной мост, сделав его каменным. А проездные ворота под церковью упразднить, так как сотрясение от проезда груженых телег разрушало здание. Прежний надвратный храм стал южным приделом нового храма, с севера был пристроен равный по площади придел. Старый собор с наружной стороны был обложен в два с половиной кирпича и испещрен резными белокаменными украшениями. Так как внутренняя стена нового придела раньше была внешней стеной храма, то на ней сохранились куски белокаменной кладки XVI века, кирпичные части XVII века, а из украшений – угловые колонки, карниз с поребриком и декоративные кокошники. Надвратный храм был богато декорирован на средства домовой казны патриарха Иоакима родом из Можайска, имевшего здесь владения. Реставрация храма идет крайне медленно, и у вас еще есть возможность поискать следы разных эпох. Позже все могут закрыть свежей росписью и киотами.
Когда-то храм венчала ротонда с куполом, настолько просторная, что в ней был устроен еще один придел. По сторонам ротонды стояли четыре главки-беседки на тонких колонках. Ротонда рухнула в 1941 году, когда немецкие войска обстреливали город. В 1960-е годы здание восстановили, старательно поправили белокаменное кружево, выточили заново шпили, поставили на место беседки. Но не было средств восстановить центральную ротонду. Вместо нее соорудили обычную плоскую крышу. В память о войне Никольский собор Можайска так и стоит без центральной главы. Словно сняв шапку по погибшим…