В испанской столице о разорении Панамы узнали 1 (11) июня. Английский посол сэр Уильям Годолфин доносил в Лондон: «Я не могу описать, какой эффект эта новость произвела в Мадриде». По его словам, королева-регент была «в таком дурном расположении духа, так рыдала навзрыд и металась в ярости, что те, кто был рядом с ней, боялись, как бы это не сократило ей жизнь». Она часами молилась, не вставая с колен, и вся страна погрузилась в траур. Англо-испанский договор, подписанный в июле 1670 года, оказался под угрозой срыва.
Стараясь успокоить испанских министров, Годолфин уверял, что его монарх не причастен к «недавнему инциденту в Америке». В письме лорду Арлингтону он обращал его внимание на то, что равновесие сил в Европе нельзя подвергать риску ради того, чтобы набить пиастрами разбойничьи кошельки.
9 (19) августа Годолфин имел аудиенцию у королевы-регента, во время которой энергично убеждал ее, что король Карл удручен случившимся. В то же время, следуя инструкциям лорда Арлингтона, посол добавил, что если испанцы предпримут враждебные действия против англичан и попытаются захватить Ямайку, король Великобритании «будет вынужден отомстить за это». В условиях, когда Испания не располагала средствами для ведения войны против Англии, королева взяла себя в руки и ответила Годолфину, что удовлетворена заверениями короля Карла о его непричастности к панамскому инциденту.
Граф де Молина, вернувшийся послом в Англию, потребовал от британского правительства суда над Морганом. Король готов был пойти на уступки испанской стороне. Впрочем, всю вину за сожжение Панамы он возложил не на командующего и участников панамской экспедиции, а на Модифорда.
Новым вице-губернатором Ямайки еще 23 сентября 1670 года был назначен полковник Томас Линч. В начале января 1671 года король подписал инструкции Линчу, к которым прилагались указ о его назначении и документ, отменяющий губернаторские полномочия Модифорда. Однако из-за бюрократических проволочек новый губернатор смог получить необходимые документы лишь в конце зимы, в Вест-Индию отплыл в апреле, а в Порт-Ройял прибыл с двумя военными кораблями — «Эсистенс» и «Уэлкам» — 25 июня.
В приватной инструкции король предписывал Линчу, чтобы «как только он возьмет под свой контроль управление и форт [форт Чарлз], во избежание каких-либо осложнений… ему необходимо арестовать сэра Томаса Модифорда и отправить домой под усиленной охраной, поскольку вопреки ясным распоряжениям короля он совершил многие преступные и враждебные акции против подданных доброго брата Его Величества — Католического Короля».
В мае 1671 года Чарлз Модифорд, сын опального губернатора, был арестован в Лондоне и заточен в королевскую тюрьму Тауэр в качестве «дополнительной гарантии» доставки его отца в Англию. В начале августа, когда эта новость достигла Ямайки, Линч понял, что настало время исполнить приказ его величества. 12 августа он заманил сэра Томаса Модифорда на борт фрегата «Эсистенс» под предлогом, что хочет «кое-что передать ему от короля». Там в пристуствии капитана Джона Хаббарта и четырех членов Совета экс-губернатору показали указ о его аресте в наказание за то, что, вопреки строгим указаниям из Лондона, он санкционировал антииспанские действия флибустьеров.
Несмотря на опасения Линча, никто не встал на защиту Модифорда и не предпринял попытки его освободить. Морган не присутствовал при аресте своего патрона — в это время он находился у себя дома, страдая от тропической лихорадки, которой заболел еще на Панамском перешейке.
15 августа в Порт-Ройяле состоялось очередное заседание Совета Ямайки, на котором были зачитаны письма и инструкции короля по поводу взятия под стражу и отправки в Англию сэра Томаса Модифорда. Через несколько дней опального губернатора переправили на борт судна «Джамайка мерчент», которым командовал капитан Джозеф Напмен. Присматривать за Модифордом должны были двенадцать военных моряков во главе с лейтенантом, специально переведенные для этого с фрегата «Эсистенс». 22 августа судно Напмена покинуло гавань Порт-Ройяла, взяв курс на Англию.
Плавание через Атлантику прошло без эксцессов. В ноябре сэр Томас Модифорд был помещен в Тауэр, где провел более двух лет; впрочем, содержался он там с должным уважением и полным комфортом.
Из грязи в князи