Она побывала в научных командировках в Японии и Северной Америке. Во время Первой мировой войны по заданию английского правительства Мэри изучала свойства угля. В палеонтологических изысканиях она разработала схему классификаций и термины, которыми ученые пользуются до сих пор. Ее научно-популярная книга «Древние растения» (1910) стала одной из первых попыток объяснить палеонтологию широкому кругу читателей. Профессор ботаники У. Г. Чалонер писал:
«Между 1903 и 1935 годами она опубликовала серию работ, которые позволили поместить ее в первую пятерку ведущих палеоботаников Великобритании того времени».
Когда в 1911 году Мэри вышла замуж за канадского исследователя Реджинальда Гейтса, она из принципа не стала брать фамилию мужа. К тому же ее имя в научном мире имело гораздо больший вес. Брак оказался неудачным. Мужу не нравились ее феминистские воззрения, возможно, имела место и профессиональная ревность. Через два года Мэри затеяла бракоразводный процесс, во время которого начала писать революционную книгу «Любовь в замужестве». Книга пропагандировала равенство сторон в браке, что было само по себе смело, но не ново: об этом уже говорили феминистки прошлого. Этого, однако, оказалось достаточно для того, чтобы книгу отвергали все издательства, в которые обращалась Стоупс. С публикацией ей помог будущий муж — бизнесмен и филантроп Хамфри Вердон Роу, опубликовавший книгу за свой счет. «Любовь в замужестве» мгновенно стала национальным бестселлером, переизданным пять раз только в год первой публикации. Имя Мэри Стоупс прогремело на всю Англию. Ей приходило до 1000 писем в неделю с просьбами о советах, и Мэри даже старалась на них отвечать.
Откуда же такой невероятный успех?
Дело в том, что Мэри Стоупс первой в мире написала о естественности получения женщинами сексуального удовольствия. Это кажется почти невероятным, но это факт: до 1918 года, когда была опубликована книга, этот вопрос в печати не поднимал никто. С юности девушкам внушалось, что половой акт — это лишь обязанность в браке, тяжкий, но необходимый для рождения детей «супружеский долг». Не только Англия, но и весь мир продолжал жить в викторианской морали, сформулированной как анекдотическая фраза, которой королева Виктория напутствовала свою дочь перед первой брачной ночью:
«Закрой глаза и думай об Англии».
Мэри Стоупс призывала супружеские пары не «думать об Англии», а жить в счастливом браке, включающем в себя «великолепный секс». Помимо женского сексуального желания, Стоупс писала о менструации, овуляции и методах контрацепции, описанной не с точки зрения церковной морали, а впервые в истории — с точки зрения медицины, что буквально взорвало общественность. Это вызвало сопротивление Церкви, конфликт с которой продолжался у Стоупс до конца жизни. В 1935 году «Любовь в замужестве» признали в числе 25 самых влиятельных книг за последние 50 лет наряду с работами по теории относительности Эйнштейна и «Толкованием сновидений» Фрейда. Стоупс, без преувеличения, стала одной из тех, кто сформировал XX век, а как следствие — и наш нынешний XXI век, в котором книгу Стоупс отлично помнят даже в поп-культуре: например, ее упоминали дважды в известном сериале «Аббатство Даунтон».
Но среди самых влиятельных книг недаром была названа и «Моя борьба» Гитлера. Наброски книги Стоупс показала американской феминистке Маргарет Сингер, открывшей первую в США клинику по контролю рождаемости. Сингер была, с одной стороны, такой же пионеркой прогресса, а в ее клинике работали женщины и темнокожие сотрудники из беднейшего района Гарлем. С другой стороны, в своей деятельности по продвижению контрацепции Сингер придерживалась принципов негативной евгеники, взятой на вооружение нацистами, отстаивала превосходство белой расы и предлагала насильственную стерилизацию лиц, «непригодных для воспроизводства», в числе которых называла евреев, чернокожих и славян. Мэри Стоупс стала английской Сингер.
В 1920 году она основала «Общество конструктивного контроля над рождаемостью и Национального прогресса», а при финансовой поддержке мужа 17 марта 1921 года открыла Клинику для матерей в Северном Лондоне. В клинике исследовались старые и новые методы контрацепции и репродуктивного здоровья. В 1925 году клиника переехала в Центральный Лондон, где находится до сих пор. В наше время у Организации Стоупс есть 452 офиса и клиники в Англии и других странах.