В подводную лодку "Силайэн", стоявшую в доке Кавите со снятыми для ремонта двигателями, попали две бомбы, и она была настолько разрушена, что надежд на ее восстановление не оставалось. Подводную лодку "Сидрэгон", стоявшую рядом с ней с разобранными механизмами, могла постичь такая же участь, но плавучая мастерская подводных лодок "Пиджон" взяла ее на буксир и вывела из-под удара. После этого "Сидрэгон" занял свое место в оборонительном заслоне против японского вторжения, а "Силайэн" стал первой американской подводной лодкой,, которая была выведена противником из строя. В результате воздушного нападения экипажи "Силайэна" и "Сидрэгона" потеряли пять человек; это были первые жертвы среди американских подводников в начавшейся здесь войне.
Из-за этой бомбардировки отпала надежда на то, что манильскую бухту можно будет использовать для базирования подводных лодок. При бомбардировке Кавите было уничтожено 232 торпеды. Это явилось чувствительным ударом для подводных сил Азиатского флота, которые в течение нескольких месяцев должны были вести боевые действия при острой нехватке торпед. На следующий день плавучие базы "Холланд" и "Отус" ушли из Манилы к малайскому оборонительному рубежу, чтобы сохранить имевшиеся на них запасные части и торпеды. Устаревшую плавучую базу "Канопус" оставили в Маниле, замаскировав у стенки дока.
Лодка "Суордфиш" (командир Смит) оказалась одной из первых подводных лодок Азиатского флота, установивших контакт с противником. Ночью 9 декабря по пути в назначенный район патрулирования эта подводная лодка обнаружила японские транспорты, которые шли в охранении эсминцев. "Суордфиш" форсировал в надводном положении завесу охранения и атаковал грузовое судно торпедой. Эсминец из состава охранения контратаковал подводную лодку, и она, чтобы оторваться от преследования, ушла на глубину. На "Суордфише" слышали звук сильного взрыва и решили, что их первая торпеда, выпущенная по противнику, поразила цель. Как только Смит оторвался от преследовавшего его эсминца, он всплыл на перископную глубину и выстрелил для верности по грузовому судну еще одну торпеду. Он был уверен, что грузовое судно затонуло, однако до сих пор не найдено японских документов, подтверждающих факт повреждения или потопления японского грузового судна во время этой атаки{12}.
13 декабря подводная лодка "Сивулф" (командир Уордер) подошла к Апарри. Уордер обнаружил эсминец, патрулировавший у входа в залив, и решил, что в самом заливе должна находиться более важная цель. Уордер стал вести дальнейшее наблюдение. На следующее утро "Сивулф" в подводном положении проник в залив, где обнаружил стоявшую на якоре большую японскую плавучую базу гидросамолетов "Санио-мару". Уордер выстрелил в нее две торпеды, но обе прошли мимо. Уордер развернул "Сивулф" на 180° и выстрелил еще две торпеды из кормовых аппаратов. Все торпеды были типа "Мк-14" с магнитными взрывателями. Гидроакустик "Сивулфа" доложил о взрывах, но Уордер, посмотрев в перископ, убедился, что не причинил цели повреждений. Одна из торпед попала в "Санио-мару", но не взорвалась. Неизвестно, выловили ли японцы какую-нибудь из торпед "Сивулфа" в то время, но во всяком случае это произошло незадолго до того, как они начали вылавливать торпеды, выстреленные с американских подводных лодок для тщательного изучения их. Японцы оказались достаточно мудрыми, чтобы скопировать для себя магнитный взрыватель этих торпед.
"Суордфиш" продолжал поиск японских конвоев. Прибыв в назначенный район патрулирования у острова Хайнань, "Суордфиш" трижды атаковал конвои. 15 декабря в этом районе был поврежден грузовой транспорт "Кашии-мару" (8407 тонн). На следующий день "Суордфиш" атаковал тремя торпедами судно, которое Смит определил как транспорт. Это было первое японское судно, уничтоженное торпедой с американской подводной лодки. В целом же в рассматриваемый период войны атаки американских подводных лодок, как правило, были безуспешными.
Подводная лодка "Сарго" (командир Джекобс) впервые столкнулась с противником 14 декабря 1941 года. Ее первой целью было грузовое судно водоизмещением 4000 тонн. Джекобс приказал установить глубину хода торпед 4,5 метра, надеясь, что магнитный взрыватель сработает под килем цели. Через 18 секунд после выстрела, когда торпеда прошла только около 400 метров, раздался сильный взрыв, который был хорошо слышен на "Сарго". Торпеда взорвалась преждевременно, пройдя лишь дистанцию, необходимую для перевода взрывателя в боевое положение, то есть меньше половины пути до цели. Это был первый случай преждевременного взрыва торпеды, или, точнее, первый зафиксированный преждевременный взрыв торпеды, так как во многих случаях моряки, с надеждой следя после выстрела за ходом своих торпед, принимали за попадания взрывы, которые вполне могли быть вызваны преждевременным срабатыванием взрывателя.