В ходе преследования М-172 получила множественные повреждения корпуса. Была нарушена герметичность заклепочных швов V и VI отсеках а так же центровка линии валов и приводов управления рулями, повреждено перо вертикального руля, подорваны многие клапаны забортной арматуры, вышли из строя ряд приборов и механизмов, в том числе перископ, Прибыв в базу, подводная лодка сразу отправилась на ремонт в Мурманск, где подводники насчитали в прочном корпусе 110 вмятин полученных в результате разрывов глубинных бомб. Работы, которые были совмещены установкой на корабль стабилизатора глубины «Спрут» продлились до конца сентября 1942 года.
26 октября вновь вступившая в строй М-172 вышла в свой тринадцатый Боевой поход. Она должна была действовать северо-западнее Вардё. В утренние часы 28 октября с подводной лодки на вражеское побережье была высажена разведгруппа из трех норвежцев, но 30 октября из-за поломки пальца кулачной муфты ПЛ была вынуждена вернуться в базу. Повреждения добавились 9 ноября, когда подводная лодка стояла в Палагубе у борта плавмастерской «Красный Горн», Внезапно налетевший шквал ударил подводную лодку о рядом стоящую М-174. Ремонт продлился до середины декабря; подводная лодка получила пробоину в прочном корпусе, а перо носовых горизонтальных рулей правого борта было смято.
Кампанию 1942 года М-172 завершила выходом в Варангер-фьорд. За неделю патрулирования встреч с противником из-за плохой видимости и шторма не было. Утром 30 декабря подводная лодка вернулась в Полярное. Боевые действия 1943 года М-172 открыла походом северо-западнее Вардё вечером 21 января, Утром 23 января у мыса Маккаур подводная лодка атаковала эсминец типа «Galster». С подводной лодки в перископ наблюдался всплеск у его борта, после чего корабль окутался паром и начал кормой погружаться в воду, а находившиеся в отсеках слышали взрыв. К моменту атаки М-172 почти все немецкие эсминцы «типа 1936» лежали на дне у Нарвика после известных событий апреля 1940 года. Из находившихся в строю оставался только Z20 («Karl Galster»), который после войны предан по репарациям СССР и стал «Прочным». Те германские эсминцы, которые в этот момент были на Севере, после печального для немцев «Новогоднего боя» оставались в Альта-фьорде. Возможно, безуспешной атаке подводной лодки подвергся конвой, включающий в себя суда «Xainrix Shulte», «Itayri», «Alydra» и «Poseidon», который не заметил атаку ПЛ.
Утром 1 февраля М-172 у Сюльте-фьорда из надводного положения атаковала груженный никелевой рудой транспорт «Reiland», но торпеды попали в сторожевик командира конвоя V6115, который буквально разбросало на куски, часть из которых пролетело над подводной лодкой. Из экипажа корабля только семерым морякам удалось спастись, остальные 45 человек погибли. Контратаковавший подводную лодку сторожевой корабль V6110 ограничился сбросом наугад 18 глубинных бомб; на этом преследование ПЛ завершилось.
Утром 25 февраля М-172 из подводного положения выпустила две торпеды по одиночному миноносцу (вероятно, торпеды были пущены по одиночному немецкому тральщику, который не заметил атаки подводной лодки), после чего акустик подводной лодки слышал неясный скрипящий звук, а спустя десять минут, осматриваясь в перископ, подводная лодка цель не обнаружила. Прибыв в базу, М-172 встала на углубленный навигационный ремонт, в ходе которого были установлены на шумоизоляторы приводы рулей, а все приборы и механизмы поставлены на амортизаторы.
Восемнадцатый Боевой поход подводной лодки начался вечером 17 апреля. К началу следующих суток М-172 заняла район позиции №-6 в Варангер-фьорде. Противник не заставил себя ждать, после шести часов поиска у мыса Кибергнес М-172 обнаружила конвой идущий из Киркенеса. Подводной лодкой с дистанции 8 кабельтов двумя торпедами с неконтактным взрывателем был атакован крупный транспорт, а через 50 секунд в отсеках зафиксирован одинокий взрыв. Суда «Adolf Binder», «Vilma», «Кога» и «Dollart» продолжили свой дальнейший путь, а сопровождавшие их сторожевики Uj1101, Uj1106, Uj1109, Uj1102 и Uj1709 сбросили на ПЛ 54 глубинных бомбы, в результате чего М-172 получила незначительные повреждения.