Учитывая важность надежной охраны государственной границы, руководящие органы страны все годы войны, несмотря на весьма ограниченные возможности, постоянно принимают меры по усилению боевого состава пограничных округов, причем это касалось всех основных участков и направлений. В 1941 году НКВД сформировал 17 учебных полков, принявших призывников 1922 года рождения в количестве 25 000 человек, из них шесть полков готовили погранвойска. Два из этих полков были переформированы в 21-й и 26-й стрелковые полки, которые приняли участие в обороне Кавказа в составе внутренних войск НКВД. Три учебных полка, расположенных в Средней Азии, были обращены на укомплектование частей Туркменского, Среднеазиатского и Казахского погранокругов, которые выделили взамен полученного пополнения 2700 пограничников на укомплектование отдельной стрелковой дивизии особого назначения (ОСДОН) в г. Москве. Туда же влился личный состав учебного полка в г. Новосибирске.
В связи с активизацией деятельности иностранных разведок на закавказском участке границы в составе Грузинского погранокруга был сформирован 21-й пограничный резервный полк численностью 1500 человек. В это же время численность 165 береговых застав Приморского и Хабаровского погранокругов была доведена до 16 человек, на речных участках этих же округов введено в строй 62 катера.
Серьезное усиление боевого состава погранвойск на границе имело место в 1942 году. Грузинский погранокруг был усилен 40, 44 и 45-м пограничными полками, переброшенными из Москвы и Средней Азии. В составе 36-го и 37-го пограничных отрядов, входящих в состав Грузинского погранокруга, были сформированы маневренные группы численностью 250 человек каждая с дислокацией их в приморских городах Сочи, Сухуми, Гудауты и Поти с расчетом их действий против вражеской агентуры с моря. Все береговые посты Сухумского и Батумского погранотрядов переформировывались в пограничные заставы численностью в 31 человек. Дополнительно были сформированы три неотдельных комендатуры. Значительно усиливаются органы разведки в звене комендатура — отряд. Общее усиление Грузинского и Армянского погранокругов составило 6318 человек. Они получают и огневое подкрепление. В округа перебрасывается 102 противотанковых ружья и 312 минометов РМ-50.
В 1941–1942 годах отмечается усиление действий иностранных разведок со стороны Ирана. Для противодействия их намерениям усиливаются войска Туркменского и Азербайджанского погранокругов. В г. Баку формируется 1-й запасной пограничный полк в 2000 человек, позже он переформировывается в 126-й пограничный полк и принимает участие в обороне Кавказа. В г. Ашхабаде формируется 42-й пограничный полк численностью в 1643 человека, взамен убывшего в Грузинский погранокруг 44-го погранполка. Из Забайкалья в г. Мары Туркменской ССР передислоцируется 47-й пограничный полк. Пограничные отряды Азербайджанского и Туркменского погранокругов пополняются подразделениями связи. Общее усиление этих округов составило 1171 человек.
Резко обостряется обстановка на афганском участке границы, где активно действует нацистская разведка, а также подчиненные и взаимодействующие с ней разведорганы других иностранных государств. Проходя службу в те годы на Памире, автор имел возможность лично убедиться в этом. Отмечались неоднократные попытки захвата сопредельной стороной советских островов на реках Пяндж, Памир и Аму-Дарья. Для усиления численности погранвойск в г. Сталинабаде формируется 43-й пограничный полк, взамен убывшего в Грузинский округ 45-го погранполка. 48-й погранотряд, 15-й и 26-й отдельные погранкомендатуры укомплектовываются до полного штата, в них увеличивается число пограничных застав. В состав 66-го Памирского погранотряда в г. Хороге вводится дополнительно одна комендатура, три линейных заставы и увеличена численность двух линейных застав.