Что касается уголовного дела в отношении Л. П. Берии, которое, кстати, до сих пор остается во многом засекреченным, то оно было заведено лишь 30 июня 1953 года, а само Постановление Генпрокуратуры СССР о его аресте было подписано и того позже — только 3 июля 1953 года. При этом, что довольно любопытно, сама процедура регистрации арестованного Л. П. Берии, которую проводил следователь по важнейшим делам Генпрокуратуры СССР государственный советник юстиции 3-го класса П. К. Цареградский, была проведена с грубейшим нарушением закона, поскольку в бериевской анкете полностью отсутствуют отпечатки его пальцев, его фотографии в профиль и анфас и т. д. Более того, как отмечал полковник юстиции А. В. Сухомлинов[314]
, который как бывший военный прокурор входил в состав комиссии по реабилитации Л. П. Берии и его «подельников» и детально знакомился со всеми 39 томами его следственного дела, период нахождения «лубянского маршала» в бункере штаба Московского военного округа 27 июня — 23 декабря 1953 года нигде не описан, и посему о его пребывании в этом бункере можно судить только по воспоминаниям очевидцев и материалам самого уголовного дела.В самом уголовном деле содержатся 24 протокола (главным образом копии протоколов) допросов Л. П. Берии, которые проводились с 8 июля по 17 ноября 1953 года самим генпрокурором Р. А. Руденко и тем же советником юстиции 3-го класса П. К. Цареградским. Но, как верно отметили многие исследователи, в частности тот же А. В. Сухомлинов, 90 % листов бериевского уголовного дела являются не подлинниками, а машинописными копиями, которые заверены майором административной службы Главной военной прокуратуры Н. А. Юрьевой, без оригинальных подписей следователей и самого Л. П. Берии.
Вскоре по «делу Берии» были арестованы и ряд его ближайших соратников, в том числе министр Госконтроля СССР генерал армии Всеволод Николаевич Меркулов, первый заместитель министра внутренних дел СССР генерал-полковник Богдан Захарович Кобулов, начальник Следственного управления МВД СССР генерал-лейтенант Лев Емельянович Влодзимирский, начальник 3-го Управления МВД СССР генерал-полковник Сергей Арсеньевич Гоглидзе, министр внутренних дел УССР генерал-лейтенант Павел Яковлевич Мешик и министр внутренних дел ГССР генерал-лейтенант Владимир Георгиевич Деканозов.
Между тем 15 сентября 1953 года генпрокурор Р. А. Руденко направил на имя Г. М. Маленкова предложения о порядке рассмотрения дела Л. П. Берии[315]
, в которых «в связи с окончанием следствия по делу Берия Л. П.» и с учетом того, что «большинство материалов дела составляет государственную тайну», предложил: 1) рассмотреть это дело в закрытом заседании Верховного суда СССР, поскольку подобная процедура рассмотрения дел о террористической деятельности предусмотрена Законом от 1 декабря 1934 года, принятым ЦИК СССР в день убийства Сергея Мироновича Кирова; 2) слушать данное дело без участия сторон, т. е. прокурора и адвоката, и 3) поручить рассмотрение этого дела Специальному судебному присутствию Верховного суда СССР в составе трех судей: председательствующего — председателя Верховного суда СССР А. А. Волина, первого заместителя председателя Верховного суда СССР Е. Л. Зейдина и председателя Судебной коллегии по уголовным делам Верховного суда СССР Н. К. Морозова. А спустя всего два дня, 17 сентября 1953 года, на основании этих предложений Президиум ЦК принял решение поручить генпрокурору Р. А. Руденко и секретарю ЦК М. А. Суслову доработать с учетом всех правок, принятых на заседании Президиума ЦК, сам проект обвинительного заключения по «делу Берии»[316].