Вплоть до начала XIX века анатомия (от греч. anatome — «рассечение») не считалась самостоятельной дисциплиной. Наука о внутреннем строении организма долгое время объединялась с физиологией, патологией и патологической физиологией. Изучение всех направлений проходило в тесной связи с хирургией. Оттого выдающиеся анатомы прошлого являлись одновременно превосходными терапевтами, хирургами, физиологами. В настоящее время различается анатомия животных и анатомия растений. Самостоятельным разделом выступает анатомия человека, в свою очередь, разделяющаяся на нормальную и патологическую анатомию. Кроме того, существует такая дисциплина, как сравнительная анатомия животных. Анатомическая школа появилась в России и прославилась на весь мир благодаря Петру I, правильно понимавшему глубокий смысл фразы «врач не анатом не только бесполезен, но и вреден». Император всегда проявлял большой интерес к медицине, способствовал развитию медицинского дела как на практике, так и в теоретической области. Часто бывая за границей, он имел возможность встречаться с самыми знаменитыми учеными Европы: А. ван Левенгуком, Г. Бурхааве, И. Ньютоном. Пётр I внимательно изучал методы работы Лейденского и Оксфордского университетов. Во время пребывания в Голландии познакомился с Ф. Рюйшем, неоднократно посещал его лекции, интересовался экспонатами знаменитого Анатомического музея. Отметив интерес русского царя к медицине, нидерландский анатом позволил ему присутствовать на операциях и вскрытиях. В здании, где проходили аутопсии, специально для Петра I была устроена тайная дверь, через которую император мог пройти незаметно, предварительно получив извещение от Рюйша.
Сразу после возвращения на родину в 1699 году воодушевленный император устроил для придворных своеобразные курсы по анатомии. По негласному правилу «советы» и «приглашения» монарха считались строго обязательными, потому бояре безропотно посещали лекции и вскрытия, вынужденно взирая на невиданное до того «трупоразодрание».
Сам император принимал непосредственное участие в анатомировании, «редко пропуская такой случай, чтоб не присутствовать при оном, и часто даже помогал операциям. Co временем приобрел он в том столько навыку, что весьма искусно умел анатомировать тело, пускать кровь, вырывать зубы, делая то с великою охотою».
В 1717 году Пётр I купил анатомический кабинет Рюйша, положив начало Кунсткамере, первому русскому музею редкостей. В настоящее время петровская коллекция размещена в Санкт-Петербурге, в здании Музея антропологии и этнографии Российской академии наук. По указу императора с 1718 года пополнение коллекции стало заботой не только ученых, но и каждого российского гражданина.
Преподавание медицины во времена Петра I проходило строго в естественно-научном направлении. Слушатели анатомических лекций, помимо «Врачевской анатомии» Е. Славинецкого, пользовались учебниками иностранных авторов на латинском и немецком языках.
В начале XVIII века по заказу Петра I на русский был переведен рукописный анатомический атлас Готфрида Бидлоо «Анатомия человеческого тела в 105 таблицах» (1685). Если профессор Готфрид прославился в России как автор превосходного учебника, то его племянник Николас ван Бидлоо стал «ближним доктором», или лейб-медиком, императора, а позже руководителем госпитальной школы за Яузой. Его рукописное руководство «Наставление для изучающих хирургию в анатомическом театре» в печатном варианте впервые увидело свет только в 1979 году.
Книга русского доктора Мартына Ивановича Шеина (1712–1762 годы) также создавалась на латинском языке. Атлас анатомии «Словник, или иллюстрированный указатель всех частей человеческого тела» (1744) сыграл немалую роль в развитии отечественной анатомии и хирургии. Книга проиллюстрирована самим автором. В 1757 году он лично перевел на русский язык «Сокращенную анатомию, все дело анатомическое кратко в себе заключающую» Л. Гейстера, таким образом предоставив российским медикам практическое руководство по анатомии на родном языке.
Одной из многочисленных заслуг Шеина стали долгожданные переводы анатомических и медицинских терминов. До него русской медицинской терминологии не существовало. Искренне веря в светлое будущее отечественной науки, доктор повторял: «География, навигация, архитектура, медицина и прочие знания, которые прежде всего в России мало известны были, ныне столько нам открыты. Мы уже имеем пригодных российских географов, мореплавателей, архитекторов и медиков и, может быть, в краткое время потомки наши увидят все оное в гораздо большем совершенстве». Среди анатомов, одними из первых преподававшими медицину на русском языке, наиболее известны К. Щепин (1728–1770 годы) и ученик М. Ломоносова академик А. Протасов (1724–1796 годы).