После эпидемии 430 года до н. э., когда чума унесла жизни нескольких тысяч человек, представители светской медицины «сложили оружие», невольно направить внимание эллинов к магическому врачеванию. Священная змея из Эпидавра переместилась в Афины, почтив своим присутствием новый асклепион, возведенный на склонах Акрополя. Впрочем, усиленное внимание к полузабытому ритуалу приветствовалось далеко не всеми жителями Греции. В комедии Аристофана «Плутос» с большой долей сарказма представлены обряды, посвященные Асклепию. От имени мнимого больного автор высмеивал меркантильность служителей храма:
Рамки семейных медицинских школ расширились в классический период истории Древней Греции. Начиная с V века до н. э. периодевты за определенную плату принимали воспитанников. Во времена расцвета государственности появилась потребность в новых знаниях, что в итоге привело к созданию многочисленных философских школ. Врачевание предыдущего периода основывалось на едином учении — натурфилософии, воплотившей в себе умозрительное толкование природы, изучение ее в целостности. «Ни одна вещь не возникает и не исчезает, так как всегда сохраняется одна и та же природа», — утверждал Аристотель.
Приверженцы натурфилософии придерживались идеи вечной и неизменной первоосновы всего существующего на Земле, первоматерии, из которой якобы все возникает и в нее же возвращается вновь. Каждый мыслитель старался найти собственное обоснование общей концепции. Например, Фалес из Милета (624–546 годы до н. э.) искал истоки в Мировом океане. Его адепт и соотечественник Анаксимен (585–525 годы до н. э.) утверждал, что первоматерией является воздух. В разреженном виде атмосфера дает огонь. Сгущаясь, она создает ветер, тучи, влагу, почву и камень, причем качество образований зависит от количества первоматерии.
Философ Анаксимандр из Милета (611–546 годы до н. э.) впервые попытался объяснить появление земных и небесных объектов, не уповая на богов, то есть с рациональной точки зрения. Он нашел первоматерию в бесконечной, постоянно меняющейся субстанции, назвав ее «апейрон». В вечном движении видел основу жизни Гераклит (554–483 годы до н. э.). Ученый из Эфеса добавил к существующим принципам натурфилософии идею единства и борьбы противоположностей, тем самым заложив основы диалектики.
Еще дальше продвинулся Левкипп из Абдер (500–440 годы до н. э.) предположивший, что материя состоит из мельчайших неделимых частиц — атомов. Взяв за основу эту гениальную мысль, мудрец Демокрит родом из тех же Абдер (460–371 годы до н. э.) существенно расширил доктрину своего предшественника, предложив единую систему древнего атомизма. По легенде, философ Демокрит обучался у чернокнижников — халдеев, подаренных его отцу персидским царем Ксерксом. Растратив наследство родителя на путешествия, молодой ученый успел посетить Персию, Вавилон, Египет и даже Индию. Обитая в Афинах, он тайно слушал Сократа, встречался с Анаксагором. Несмотря на утвердившееся мнение о влиянии Левкиппа, многие относят на счет Демокрита создание атомизма как универсального философского учения, объединяющего физику, космологию, эпистемологию, психологию, этику. Демокрит написал более 70 сочинений по различным прикладным наукам, в том числе и медицине. Его перу принадлежит трактат «О священных надписях в Вавилоне» и «Халдейская книга».