Главным положением теории Демокрита является противопоставление атомов и пустоты. Как мельчайшее тело, атом неделим по той же причине, по какой неделимо бытие. Однако деление предполагает наличие пустоты, но внутри атома пустоты нет. Современники Демокрита расценили введение понятия «атом» как реакцию на проблему деления до бесконечности, обсуждавшуюся ранее. Философу из Абдер принадлежит идея космогонии. Согласно его суждениям, бесконечные по количеству атомы постоянно движутся в пустоте. Сталкиваясь и сцепляясь, они переплетаются, образуя бесчисленные миры (космосы). Учение о душе, или гносеология, по Демокриту, выявила зависимость признаков вещей от способа их познания, то есть от наличия наблюдателя. Все признаки могут быть сведены к количественным различиям атомов. Так, тело, состоящее из «круглых и умеренно больших» атомов, кажется сладким. Горький вкус у тел, собранных из «округленных, гладких, косых и малых по величине» частиц.
Знаменитый мыслитель Платон (427–347 годы до н. э.) совершил переворот в античной философии, противопоставив материю сознанию. Ученик Сократа основал в Афинах школу, получившую название Академия Платона. В представлении потомков словосочетание «афинская школа» является не только местом, где собирались ученые мужи. Это понятие выражает высшую степень интеллектуального подъема, торжество человеческого разума, сосредоточенное в высказываниях великих людей, собиравшихся вокруг Платона. Высшая из его идей — принцип вечных и постоянных прообразов вещей, временного и капризного бытия; вещи же есть подобие и отражение идей.
Познание, по Платону, является воспоминанием души об идеях (анамнесис), которые она созерцала до соединения с телом. Любовь к идее, отождествленную с эросом, он рассматривал как побудительное обстоятельство духовного восхождения. Платон развил и дополнил основные установки предшествующей философии. Противопоставляя божественную и человеческую мудрость, он создал учение о бессмертии души и о должном воспитании философа: душа не берет с собой на тот свет ничего, кроме «воспитания и образа жизни». Платон сравнивал человеческую душу с колесницей, запряженной белым и черным конями (возвышенное и низкое начало в человеке), управляемую возничим, то есть разумом. Когда кучеру удается смирить низменное начало, душа поднимается и вместе с богами созерцает подлинное бытие.
Древнегреческий мудрец задолго до Канта определил метод познания: «…не во впечатлениях заключается знание, а в умозаключениях о них, ибо именно здесь можно схватить сущность и истину, там же — нет». Философская школа Платона, единственная, просуществовавшая до конца античности, была закрыта императором Юстинианом в 529 году. Обосновавшись в Месопотамии, сторонники эллинского ученого продолжали проповедовать до X века, сохранив реальные достижения античной философии для Западной Европы и Византии.
Классические системы античной философии, основанные на естественно-научном (материалистическом) учении Демокрита и объективно-идеалистической теории Платона, в равной мере оказали влияние на медицину. Натурфилософия указала путь к изучению основных причин болезни, следовательно, — к поиску правильных методов ее лечения. Философская тенденция к упорядочиванию знаний побудила медиков к теоретическому обоснованию своих методик, то есть к появлению истории болезни. Дальнейшее развитие врачевания протекало в научном русле, в рамках передовых школ, начавших свое существование за пределами Греции.
В VI–V веках до н. э. эллинскую медицину представляли знаменитые школы, самой старейшей среди которых была книдская, руководимая асклепиадами. Она заложила основы кротонской научной системы, действовавшей в Южной Италии, именуемой тогда великой Грецией. Затем к ним присоединилась сицилийская школа, возглавляемая Эмпедоклом.
Славную косскую школу представлял Гиппократ. Менее значимые школы, киренская в Африке и родосская на острове Родос, просуществовали недолго и в искусстве врачевания заметного следа не оставили.