Храм был возведен на месте готического костела XIII века в 1704-1711 годах по проекту Криштофа Динценгофера. Собор представляет большое однонефное сооружение. По бокам к нефу примыкают капеллы. Сильно акцентированная алтарная часть перекрыта мощным куполом (длина 20 м, высота вместе с фонарем 79 м). В барабане купола – восемь больших окон, хорошо освещающих интерьер хора и нефа. Интерьер храма поражает необычайно пышным убранством – столбы и нарядные карнизы облицованы искусственным мрамором. Перед ними установлены деревянные раскрашенные и позолоченные скульптуры. Под куполом – скульптуры отцов церкви, исполненные Игнацем Платцером, в главном алтаре – медная фигура св. Микулаша, исполненная тем же мастером. Стены храма почти сплошь украшены фресками работы Я. Л. Кракера, Ф. Кс. Палка, Й. Гагера, Й. Крамолина и Й. Редельмайера. Фресковые росписи храма дают полное представление о характере барочной фресковой монументальной живописи. Изображенные на фоне облаков фигуры даны в стремительных движениях, их жесты полны экспрессии, патетики. Резкие светотеневые контрасты усиливают впечатление беспокойной динамики росписи, которая как бы расширяет реальные границы подкупольного пространства.
К 1710 году был закончен основной фасад храма. Богато расчлененный, изобилующий скульптурным декором, построенный на контрасте углубленных и выступающих частей, он выполнен в традициях иллюзорного римского барокко. Ни один из фасадов храма не позволяет судить о характере интерьера храма, о системе его планировки. Он скорее маскирует внутреннее членение, конструкцию сооружения. Такой прием характерен для барочной архитектуры вообще и для творчества Динценгоферов в частности.
В 1737-1752 годах архитектор Килиан Игнац Динценгофер достраивает алтарную часть храма, перекрытую куполом, а немного позднее, в 1755 году, зодчий Ансельмо Лураго, зять Динценгофера, возводит стройную колокольню храма. До 1879 года аттик храма украшали скульптуры Игнаца Платцера (впоследствии они были сняты).
Как и многие пражские памятники культовой архитектуры, храм св. Микулаша тесно связан с музыкальными традициями Праги. Уже в XIV веке среди священников старого собора св. Микулаша, стоявшего на месте современного, упоминается органист Микулаш. Музыка и впоследствии занимала важное место в жизни собора. В 1791 году здесь служили заупокойную мессу по Моцарту. Был исполнен реквием чешского композитора Франтишка Рёслера.
Поблизости от Карлова моста расположен живописный остров Кампа – часть Малой Страны. Под этим названием остров известен с 1770, наиболее ранние упоминания о нем восходят к 1169 году; в XIV столетии Кампа назывался просто Островом.
Остров Кампа отделен от Малой Страны маленьким рукавом Влтавы Чертовкой. Сначала остров был сплошь покрыт садами, дома здесь стали строить лишь со второй половины XVI века. Наиболее ранними и интересными сооружениями в южной части острова Кампа являлись так называемые Сововы мельницы, известные уже в XIV веке (сейчас на их месте стоит дом XIX в.).
Как уже говорилось ранее, Малая Страна в целом интересна прежде всего памятниками искусства XVII-XVIII веков, но есть здесь и несколько уцелевших памятников готического периода, среди них – костел св. Яна. Самой древней сохранившейся частью костела является неф, восходящий к середине XIII века. Костел неоднократно перестраивался в XVI-XVIII веках; в 1797 году его приспособили под прачечную, и с этого момента он стал называться костелом св. Яна «на прадле» (по-чешски «pradlo» значит белье).