В письме Г. Г. Карпова заведующему IV отдела НКИД СССР А. П. Павлову об условиях перехода Чешской епархии в юрисдикцию Московского Патриархата от 7 декабря отмечалось: «…патриарх Московский и всея Руси Алексий благожелательно относится к этому факту, однако считает, что присоединение может быть проведено только лишь при наличие согласия на это со стороны Сербской церкви… Никаких практических переговоров о порядке перехода в ведение Патриархии, до получения согласия на это от Сербской церкви, патриарх вести не может, поэтому присылка церковной делегации для этой цели сейчас нецелесообразна. Принять же в качестве гостей представителей Чешской церкви патриарх не возражает…».[157]
Еще 26 ноября в Прагу приехал сербский епископ Мукачевско-Пряшевский Владимир (Раич). На собрании духовенства и мирян Владыка заявил, что прибыл помочь Чешской епархии, как она и просила ранее. Его попросили рукоположить несколько священников и диаконов, но при этом разъяснили причины решения о перемене юрисдикции. Сербский Священный Синод в послании от 19 декабря 1945 г. выразил возражения против решения Епархиального собрания, посчитав изменение юрисдикции канонически неправильным.[158]
10 января 1946 г. в Москву прибыла делегация Чешской епархии во главе с епископским администратором протоиереем Честмиром Крачмаром (в составе еще двух священников и трех мирян). От имени Оломоуцкого съезда делегация просила Патриарха Алексия I о принятии епархии в юрисдикцию Московского Патриархата и назначении в Прагу епископа для управления епархией. Приехавший в составе делегации товарищ министера народного просвещения Карел Чермак от лица правительства поддержал это ходатайство. Такую же позицию занял и посол Чехословакии в СССР Й. Горак.[159]
На заседаниях Священного Синода 10 и 14 января был обсужден этот вопрос. 14 января Патриарх дал принципиальное согласие и подписал «Определение об условиях приема Чешской Православной Церкви в состав Московской Патриархии», в котором говорилось о том, что Священный Синод считает возможным просить Сербскую Православную Церковь отпустить Чешскую епархию в юрисдикцию Московского Патриархата и на территории Чехословакии создается экзархат Московской Патриархии с правами автономии, предусмотренными уставом Чешской православной епархии 1929 г. Таким образом, в Чехословацкой Православной Церкви сохранялись формы церковной жизни, учрежденные епископом Гораздом с согласия Священного Синода Сербской Церкви и отвечавшие традиции и потребностям чешского народа. Определение было принято делегацией без оговорок.[160]
В 1970-х гг. в одной из статей митрополита Пражского и всея Чехословакии Дорофея так оценивалась роль Московского Патриархата в становлении Чехословацкой Православной Церкви: «Когда наши верующие и Церковь оказались в трудном положении в результате жестоких преследований нацистов… Патриарх Алексий сразу после освобождения Чехословакии утешил их, проявил попечение о Церкви, протянул руку помощи».[161]
14 января председатель Совета по делам Русской православной церкви Г. Г. Карпов устроил прием в честь чешской делегации, на котором произнес речь о положении Церкви в СССР и задачах Совета. На следующий день делегация отбыла на родину.[162]
В докладной записке Г. Г. Карпова заместителю председателя Совнаркома В. М. Молотову по этому поводу говорилось следующее: «Русская церковь готова принять на себя управление в Чехословакии, но и патриархом в беседе со мной высказывалось мнение о временном характере такой меры. По его мнению, через несколько лет будет удобнее предоставить Чехословацкой церкви независимость. По справке нашего посла в Праге, такого же мнения придерживается Президент Чехословакии Бенеш».[163]5 февраля Епархиальное собрание Чешской епархии одобрило итоги поездки своей делегации в Москву. Правда, из материалов отчета К. Чермака о поездке в Москву следует, что делегаты просили назначить экзархом сербского епископа Владимира (Раича), но «эта просьба не нашла сочувствия у патриарха».[164]
Вскоре начались переговоры священноначалия Русской Церкви с Сербским Патриархатом, сначала в Москве, а затем в Югославии. Следует упомянуть, что Сербский Архиерейский Синод планировал послать в Прагу с целью оценить реальное состояние Чешской епархии епископа Банатского Дамаскина, служившего в Чехословакии в 1931–1938 гг. Однако югославские коммунистические власти, стремясь ослабить Сербскую Церковь, несмотря на неоднократные заявления, так и не выдали епископу Дамаскину визу для поездки.[165]