Царь Ирод Антипа (сына царя Ирода Великого) приказал посадить пророка Иоанна в темницу в крепость Махерунт, находившуюся близ Мертвого моря на границе с Аравией. Ирод поступил так, потому что Иоанн обличал и укорял его за оставление своей законной жены (дочери аравийского царя Арефы) и за незаконное сожительство с Иродиадой. Иродиада до этого была замужем за родным братом Ирода, Филиппом.
В день своего рождения Ирод устроил пир, на который съехалось много знатных гостей. Саломия, дочь нечестивой Иродиады, своей нескромной пляской во время пира до того угодила Ироду и возлежащим с ним гостям, что царь с клятвой обещал ей дать все, чего ни попросит она, даже до половины своего царства. Танцовщица, наученная матерью, просила дать ей тогда же на блюде голову Иоанна Крестителя. Ирод уважал Иоанна как пророка, поэтому он опечалился от такой просьбы. Однако постеснялся нарушить данную им клятву и послал стража в темницу, который отсек Иоанну голову и отдал ее девице, а та отнесла голову своей матери. Иродиада, надругавшись над отсеченной святой главой пророка, бросила ее в грязное место. Ученики Иоанна Крестителя погребли его тело в самарянском городе Севастии.
Святой Иоанн, как при жизни своей, так и после кончины был Предтечей Христу. Предварив сошествие Господа во ад, он благовествовал находившимся в аду Бога, явившегося во плоти, и порадовал святых праотцев. С ними он был изведен из ада после разрушения его по воскресении Христовом и сподобился многих венцов в Царствии небесном: как девственник, как пустынножитель, как учитель и проповедник покаяния, как пророк, как Предтеча и Креститель и как мученик.
Когда была усечена честная глава святого Иоанна Предтечи (Мф. 14, 11), когда Саломия приняла ее на блюде и отнесла своей матери, тогда Иродиада пронзила иглой язык святого, который обличал ее беззаконие, и, надругавшись над честной главой, не позволила предать ее погребению вместе с телом святого. Она боялась, что Иоанн, если погребут тело его вместе с главою, воскреснет и снова станет обличать ее. Главу святого Иродиада глубоко закопала в своем дворце в тайном нечистом месте. Об этом знала лишь жена одного из царских слуг, Хузы, по имени Иоанна (о ней упоминает святой евангелист Лука – Лк. 8, 3). Эта женщина, скорбя сердцем об убиении великого святого пророка Иоанна и о поругании над его честной главой, тайно взяла ночью эту святыню, положила ее в скудельный (глиняный) сосуд и погребла на Елеонской горе (или Масличной; это одна из гор к востоку от Иерусалима), в одном из поместий Ирода. Между тем до Ирода дошли слухи об Иисусе Христе. Он вместе с Иродиадой стал думать, уж не Иоанн ли это, воскресший из мертвых. Они стали искать главу Иоанна и, не находя ее, приходили в недоумение. Ирод даже так сказал своим домашним об Иисусе: «Это – Иоанн, которому я повелел усекнуть главу. Ныне он воскрес из мертвых, и потому чудеса делаются им» (Мф. 14, 2; Лк. 6, 16).
Спустя много времени некий весьма знатный вельможа по имени Иннокентий уверовал в Иисуса Христа. Оставив мир, он пришел в Иерусалим, купил на горе Елеонской то место, которое некогда принадлежало Ироду, построил там себе келью и стал иноком, исполняя заповеди Христовы. Желая построить для себя небольшую каменную церковь, он начал копать ров для фундамента. И вот, по Божьему смотрению, он обрел сосуд с главой Предтечи Христа. По различным благодатным знамениям и чудесам и по откровению от Бога он понял, что эта глава принадлежит святому Иоанну, и стал с большим благоговением хранить ее у себя. Так произошло первое обретение главы.
Перед его кончиной по всей стране распространилось неверие: цари чтили идолов вместо истинного Бога, повсюду в Иерусалиме были поставлены идолы. Этот инок перед своей смертью, боясь, как бы святыня не была поругана неверными, снова скрыл ее в том самом месте, где обрел. После его кончины та церковь пришла в ветхость, разрушилась и даже сравнялась с землей, так что долгое время никто не знал, где находится честная глава Крестителя Иоанна.