При окончании всенощного бдения, во время пения великого славословия, святитель, придя к одру, на коем лежало тело преподобного, подняв его своими руками вместе с духовенством, благоговейно переложили его в серебряную раку 5 декабря. Все находящиеся там с великим страхом взирали на тело преподобного Александра. Перед началом Божественной литургии святитель освятил храм Святого Христова Преображения и придел великого чудотворца Александра и совершил Божественную службу. После чего, благодаря Бога и угодника его, преподобного Александра, каждый с радостью отправился в путь свой.
Через некоторое время благочестивая Царица Евдокия прислала покров на многочудесные мощи преподобного Александра, вышитый собственными ее руками и благородных детей ее. На нем вышит образ Святой Живоначальной Троицы и преподобного отца Александра и украшен он золотом, серебром и бисером с драгоценными камнями, который можно видеть и теперь, благодатию Христовою.
За все же это, братие, воздадим хотя малое благодарение Богу, говоря: «Слава Тебе, Господи Боже наш, яко сподобил ны еси видети таковое сокровище, многими леты сокровенное, и не лишил ны еси таковаго превеликаго дара, сего преподобного отца, и молим Тя; якоже изволил еси зде явити нам нетленны мощи преподобного сего на исцеление душам и телесем нашим, такожде сподоби ны и в будущем веце с ним наследити вечная благая Твоя».
«Блажим и тебе, пречестная главо, исполненная благодати Святаго Духа, преподобне и богоблаженне отче наш Александре, яко сподобил ны грешныя видети честныя твоя и многоцелебныя мощи, и молим тя, предстателю и молитвениче наш ко Владыце Христу: помяни нас, принесших ти малое сие словесное служение от усердия, и послушающих оное, и буди нам помощник зде и в будущем веце, и не лиши нас участия твоего в Царствии Небеснем».
Вас же, братие, молю, поревнуем добронравию преподобного сего, потщимся благоугодити Богови, любовию к Тому Самому Богу Единому и ближнему нашему, к сему же постом, и молитвами, и милостынею яже к нищим, и покрыем себе от всех навет вражиих, якоже шлемом, нелицемерным смирением; да сие сотворше, обрящем себе Бога милостива, и преподобнаго сего молящася о нас, яко о присных чадех своих, и молитвами его получим будущая благая в день судный о Христе Иисусе Господе нашем, Емуже подобает всякая слава, честь и держава, со безначальным Его Отцем, и со Пресвятым и благим и Животворящим Духом, ныне и присно и во веки веков. Аминь.
После описанных событий, мощи преподобного Александра долгие годы лежали на вскрытии в Преображенском храме. А в 1817 году архимандритом Товией была заведена традиция: в празднование дней Святой Троицы и Святого Духа мощи преподобного Александра переносились из Преображенского собора в Троицкий, а спустя 2 дня их возвращали обратно в Преображенский собор.
Но после революции и установления советской власти мощи преподобного Александра не избежали общей участи. 20 декабря 1918 года, после нескольких неудачных попыток, мощи святого преподобного Александра Свирского увезли из Александро-Свирского монастыря. Первоначально их поместили в городе Лодейное Поле в часовне при больнице. Причем часовня тут же была опечатана властями. Мощи несколько раз освидетельствовали. Результаты освидетельствований совершенно не совпадали между собой. Изымавшие мощи активисты высказывались о них, как о восковой кукле. А академик П. П. Покрышкин сделал следующее заключение: «Признавая мощи преподобного Александра Свирского безусловно исторической реликвией, местонахождение которой должно быть в храме, просим принять меры по охранению этой народной исторической ценности».
Действительно, некоторое время спустя они были переданы в анатомический музей Военно-Медицинской Академии. Как рассказывали впоследствии сотрудники кафедры нормальной анатомии Военно-Медицинской Академии, в годы революции в их музее появился экспонат, который так и оставался незарегистрированным в скрупулезно составленных каталогах музея.
До 1954 года надежную защиту мощам преподобного Александра обезпечивал академик Владимир Николаевич Тонков, происходивший из графской семьи по отцовской линии и из священнической по линии матери. Он постарался сделать так, чтобы про мощи просто забыли. После его кончины сохранность мощей обезпечили его ученики.
В 90-х годах XX века в связи с падением советской власти Церковь получила свободу, ей были возвращены многие храмы и обители, в том числе и Александро-Свирский монастырь. Тогда же встал вопрос о местонахождении мощей преподобного Александра Свирского. И началась история второго обретения мощей.
Второе обретение мощей преподобного Александра Свирского