В основном придерживаясь политики Демократической партии, Пирс в Палате представителей и в Сенате, несмотря на свое происхождение и связи с севером страны, проявил явные симпатии к рабовладельцам, называя аболиционистов возмутителями спокойствия. Правда, для того чтобы как-то приспособиться к настроениям, господствующим в северной части страны, Пирс заявлял, что считает рабство «моральным злом», но в прямом противоречии с этим утверждал, что аболиционизм должен быть уничтожен — иначе «это будет означать конец нашего Союза».
Пирс отказался от повторного выдвижения своей кандидатуры в Сенат, объясняя это сугубо семейными причинами: болезнью жены, которой был противопоказан сырой столичный климат. Видимо, сказалась и склонность к широкому образу жизни, которой не соответствовало скромное жалованье конгрессмена. Но главное состояло, очевидно, в том, что он просто не видел возможности выбиться в руководство Сената, а быть одним из многих не желал.
Завершив шестилетнюю сенатскую службу, Пирс отправился в столицу Нью-Гэмпшира Конкорд, где открыл адвокатскую контору. Естественно, бизнес бывшего конгрессмена в небольшом городе процветал. В то же время он стал одним из лидеров местных демократов и руководил различными национальными и местными избирательными кампаниями, проходившими в штате.
Уже в 1842 г. он был избран председателем организации Демократической партии в своем штате. Имея в виду, что в организации были внутренние разногласия по многим местным вопросам (строить ли железнодорожную линию, как относиться к антиалкогольному движению и др.), Пирс на словах провозглашал, что приоритетами являются «порядок, умеренность, компромисс и партийное единство», но на практике поддерживал ту фракцию, которая в тот или иной момент была к нему личностно наиболее близкой.
Когда началась война с Мексикой, Пирс записался в армию, заявив, что готов служить рядовым. Его, однако, почти сразу произвели в полковники, а затем в бригадные генералы. Он участвовал в нескольких боях, в частности в столкновении в районе города Контрерас. Этот бой оказался для Пирса буквально катастрофой. То ли он, ударившись в панику, отпустил поводья, то ли испугался конь. Так или иначе, но Пирс упал и повредил колено. У солдат создалось впечатление, что генерал проявил трусость. Хотя на следующий день он вновь возглавил свою бригаду, но на коня больше не садился. Авторитет командира был подорван. В следующие месяцы его бригада продолжала участвовать в боях и даже вступила в захваченный Мехико.
В декабре 1847 г. Пирс возвратился в Конкорд, где его приветствовали как героя. Но вскоре до Нью-Гемпшира донеслись слухи, что этот политик и военный не проявил в бою храбрости. Пирс яростно опровергал их, но они продолжали распространяться.
Участвуя в послевоенных политических спорах, главным образом по вопросам, связанным с характером и границами новых территорий, Пирс поддерживал те условия Компромисса 1850 г., которые были наиболее благоприятны южным рабовладельцам, и осуждал безоговорочное включение Калифорнии в США как свободной территории. В самом Нью-Гэмпшире демократы продолжали господствовать, и Пирс, вновь возглавивший парторганизацию, пользовался авторитетом.
В 1851 г. его сторонники стали уговаривать Пирса выдвинуть свою кандидатуру на пост президента. Он колебался. С одной стороны, воздух для демократов, по его выражению, «пах победой», так как партия вигов постепенно приходила в упадок, а новые республиканцы, набиравшие силу, все еще не пользовались высоким авторитетом. С другой — в среде самих демократов была масса претендентов, и Пирс полагал, что у него мало шансов.
Когда в начале июня 1852 г. в Балтиморе собрался съезд демократов, было ясно, что ни одна из ведущих фигур партии — Джеймс Бьюкенен, Стивен Дуглас, Луис Касс — не имеют шансов собрать требуемые две трети голосов. В течение трех дней проводились нескончаемые туры голосования, и ни один кандидат не одерживал победы. Фамилии Пирса в бюллетенях не было. Тем временем его сторонники вели тайную работу среди делегатов Юга, убеждая, что иметь в качестве президента политика Севера, чьи симпатии остаются на стороне их принципов, будет наилучшим решением. Перед 49-м голосованием представитель Северной Каролины выступил с заявлением, в котором предложил Пирса как кандидата, который должен соответствовать интересам всей партии. Результаты голосования оказались поразительными: за Пирса были поданы 282 голоса, а за всех остальных кандидатов — 5. Чтобы еще более усилить поддержку юга, кандидатом в вице-президенты был выдвинут Уильям Кинг из рабовладельческой Алабамы. Принятая съездом партийная платформа выражала поддержку Компромиссу 1850 г.