В октябре — ноябре 1944 года органы военной контрразведки 4-й ударной армии 1-го Прибалтийского фронта уничтожили несколько групп литовских националистов, которые, как выяснилось в результате допросов пленных, были связаны с немцами (как, например, члены ЛЛА Казелюнас и Матусявичюс). 17 ноября 1944 года в районе деревни Ибатуны Крокиновской волости Паневежского уезда были обнаружены сброшенные с немецких самолетов три парашюта с грузом (ящик с гранатами, три батареи питания для радиостанций, теплая одежда и т. п.). В результате поиска был задержан «адресат» этой посылки — бандгруппа из 5 человек. По показаниям одного из ее членов, И. Урбалиса, он был завербован абвером и «оставлен на территории, занятой советскими войсками, с задачей организовать группу литовских „партизан“ и присоединиться к отряду, действующему в Паневежском уезде и снабженному рацией».
В декабре 1944 года органы НКГБ Литовской ССР арестовали еще двоих немецких агентов (К. Луткявичус и П. Алекна), которые окончили немецкую разведшколу в г. Кмин-Габен и были выброшены с самолетов на территории Паневежского уезда с целью создания и объединения действующих там националистических групп. В январе 1945 года на территории Укмергского уезда был задержан агент-парашютист немецкой разведки, литовец В. Калинскас, который был заброшен в советский тыл вместе с группой диверсантов для установления связи с руководителями отрядов ЛЛА Крыштапонисом и Войтялисом и для организации диверсий на железных дорогах. В январе следующего года немецкая разведка забросила на территорию Паневежского уезда еще 5 групп парашютистов в составе 32 человек, окончивших разведшколу близ Бромберга в Восточной Пруссии (ныне г. Быдгощ, Польша). Все были снабжены оружием и взрывчаткой, три из пяти групп имели при себе портативные рации. Основной их задачей являлось создание новых формирований литовских националистов и установление связи с уже существующими отрядами для совместных действий. (Часть диверсантов была впоследствии задержана органами НКГБ Литовской ССР.)
Многие из местных руководителей ЛЛА также являлись агентами немецкой разведки, прошедшими подготовку в спецшколах абвера. В январе 1945 года органами НКГБ был арестован секретарь Зарасайского уездного штаба ЛЛА П. П. Улозас. По его показаниям, он служил ранее в немецких частях, а затем окончил разведшколу в селе Прели Каунасского уезда. При отступлении немцев он был направлен германской разведкой в Дусятскую волость Зарасайского уезда для создания диверсионных групп из литовских националистов. В другом случае, при ликвидации Тарагского уездного штаба ЛЛА, был арестован помощник руководителя волостной организации «Литовской армии свободы» Э. К. Лаугалис, который до того окончил разведшколу абвера и был переброшен в Литву. При задержании у него был изъят радиопередатчик, с помощью которого он поддерживал связь с «Абверштелле Кёнигсберг».
«Главнокомандующий» ЛЛА и самопровозглашенный «бригадный генерал» Казис Веверскис погиб 28 декабря 1944 года в стычке с милицейским патрулем у моста через Невежис[1259]
.В апреле 1945 года органы НКГБ арестовали двоих членов главного штаба ЛЛА, которые на допросе показали, что в 1944 году по соглашению с германской разведкой руководство ЛЛА выделило из своих отрядов 60 человек для обучения в немецких разведшколах и последующей заброски в тыл советских войск с диверсионно-террористическими заданиями[1260]
. Этими арестованными были Эйдимтас и Кубилюс.Адольфас Эйдимтас считался командующим ЛЛА после гибели Веверскиса. Его арестовали 4 апреля 1945 года. Вместе с 10 другими боевиками ЛЛА 9 декабря 1945 года он был приговорен Военным трибуналом НКВД к смертной казни. Приговор в отношении всех 11 боевиков приведен в исполнение 18 февраля 1946 года[1261]
.Главарь «Жемайтийского округа ЛЛА» Адольфас Кубилюс был арестован 23 апреля 1945 года. Кубилюс был арестован в деревне Вилкай близ городка Алседжяй[1262]
. На следствии показал, что с группой боевиков ЛЛА был направлен штабом ЛЛА в немецкую разведшколу в Кёнигсберге[1263]. По окончании курса он был заброшен на парашюте на территорию Тельшяйского уезда с заданием разведывательного характера. В своих радиограммах абверу он сообщал данные о дислокации штабов 3-го Белорусского фронта и о проводимых советской властью мероприятиях в Литве. Кубилюс также участвовал в создании Жемайтийского штаба ЛЛА и вооруженных формирований, для которых немцы в марте 1945 года сбросили с самолета оружие, боеприпасы и советские деньги[1264]. 9 января 1946 года Военный трибунал НКВД Литовской ССР приговорил Кубилюса и 4 его боевиков к смертной казни. Приговор приведен в исполнение 9 марта 1946 года[1265].