Кредитам при Министерстве сельского хозяйства, советник секретариата по Программе Конкурсных Грантов в проекте Мирового Банка «Развитие и Кредитование Сельского Хозяйства». С помощью данного проекта на конкурсной основе профинансировали рациональных сельскохозяйственных технологий, разработанных в научно-исследовательских институтах, опытных учреждениях и в частном секторе на сумму 1.25 млн. долларов США.
В различных зонах республики изучили нужды и проблемы сельского населения, собрали статистические данные и подготовили отчеты. Проведение экономических анализов, выбор приоритетных направлений, и на основе этого составляются соответствующие проекты. На основе разработанных критериев, позволило производить оценку. Контроль, проведение управления и финансирования проектов, рецензирование отчетов. Проведение мониторинга проектов на различных уровнях (в местах проведения проекта, финансовых документа, опрос и т. д). Составление информационной системы выполняемых проектов. Подготовлены программы по реформе в аграрных научных исследовательских институтах. Изучен опыт работы по выполнению проектов сельскохозяйственные технологий в Турции (приоритеты и их внедрение в фермерских хозяйствах) 2001 г. Румынии (порядок проведения конкурсных проектов) 2002 г. Хорватии (мониторинг, оценка и информационные системы проектов) 2002 г., Грузией (реформы системы сельскохозяйственных институтах) 2003 г. и Венгрии (система сельскохозяйственных исследований и образования) 2005 г.
Но когда узнал о назначении Рафаила Махмудова на должность руководителя зернового терминала, очень обрадовался. С 2006 по 2008 год он был избран председателем правления ООО «Бакы Тахыл Терминалы» созданного решением межправительственной комиссией экономического сотрудничества Азербайджан-Казахстан. Ведь он был достоин возглавить такой ответственный участок работы. Под его руководством для строительства терминала были подготовлены проектно-сметные документы, в стороне от моря на расстоянии 145 метров построили причал, для приобретения оборудования объявили и провели Международный тендер, из Испании в республику доставили оборудование, обладающее высокими технологическими качествами, построили зерновой терминал мощностью 500 тысяч тонн в год. Также провели тендер на строительство мельницы мощностью 150 тонн в сутки. На основе оборудовании доставленного из Швейцарской компании «Buller» завершили строительство. В открытии терминала принял участие Президент Азербайджана Ильхам Алиев. Управлять таким обществом было не просто. Предстояло провести координацию всей деятельности правления общества, налаживание связей с организациями учредителями, организовать деятельность работы исполнительной группы, а также наладить четкий трудовой ритм аппарата управления. И это все удалось решить, руководить составлением сметы затрат общества, председательствовать на мероприятиях международной и местной тендерной комиссии, вести работы по строительству и ремонту, приобретению оборудования, изучать и держать на контроле динамику контроля внутреннего зернового рынка республики, принимать близкое участие в работе международных и республиканских форумов, участвовать в работе по созданию зерновых запасов республики, организовать лаборатории качества зерна терминала. И,несмотря на большой объем работ, он успешно справлялся с возложенными на него обязанностями, и агрохолдинговая компания получила успешное развитие.
В 2011 году Р. Махмудов возглавил руководство по производству зерна первого в Азербайджане крупного зернового хозяйства ООО Kraun – Ko. На землях, арендованных из государственного фонда, на площади 30 тысяч гектаров, ученый заложил основы эффективной системы севооборота, создал семеноводческое хозяйство по производству ячменя и пшеницы. Во время открытия зернового терминала в Имишлы, был представлен Президенту Азербайджанской Республики господину Ильхаму Алиеву. В 2015 году под его руководством успешно завершилось строительство Зерноочистительной фабрики в Бейлаганском районе. И Рафаил получил самые восторженные отзывы об этом предприятии в год сельского хозяйства.
С 2008 года и по настоящее время Рафаил Умуд оглу Махмудов директор холдинговой аграрной компании ООО «Асадов Капитал Азербайджана». Он руководил строительством холодильных камер для хранения зерна и фруктов в Астаринском, Газахском, Бейлаганском районах республики.