Движение возглавляет комитет из 28 человек, а штаб-квартира путешествует по миру, в зависимости от политической обстановки. После разгрома в середине 1950‑х годов головной штаб «Братьев-мусульман» перебрался из Египта в Саудовскую Аравию. Саудиты долго использовали «братство» в своих политических целях. Когда несколько лет назад «Братья-мусульмане» пришли к власти в Египте, их главный штаб перебазировался в Каир, но потом опять покинул его и сейчас находится в Катаре, на содержании местных «газовых королей». Но это не столь важно, потому что «Братья-мусульмане» – горизонтально интегрированная сетевая структура. Группировки «братства» представляют разветвленную сеть ячеек – «джамаат исламийя» – «исламских ассоциаций». Каждая ячейка включает примерно 20 человек во главе с «амиром», руководящим ее деятельностью. Амир подчиняется вышестоящему куратору. Он информирует его о деятельности ячейки, однако в целях конспирации не раскрывает ее персональный состав. Ячейки в лице амиров и кураторов образуют «усар исламийя» – «исламские семьи». У них существует специализация. Одни «семьи» занимаются вовлечением новых членов, другие – образованием и пропагандой, третьи – финансированием, четвертые – организационно-техническим обеспечением. А есть «семьи», специализирующиеся на терроризме, для чего в разных местах существуют лагеря подготовки боевиков и террористов, готовых умереть во имя Аллаха, как завещал аль-Кутб. «Герои братства» совершили множество атак и терактов, в том числе нападение на курсантов военного училища в Алеппо в 1979 году, убийство президента Египта Анвара Садата в 1981‑м, покушения на его преемника Хосни Мубарака, резню иностранных туристов в Луксоре в 1997 году и др. Но эту тему мы здесь опустим.
Не менее важна политическая деятельность «Братьев-мусульман», с 1984 года участвующих в парламентских выборах в Египте. Не имея легального статуса, они шли либо по спискам зарегистрированных партий, либо в качестве «независимых» кандидатов, набирая год от года политические очки. Идя на выборы 1987 года вместе с Либерально-социалистической партией и Социалистической партией труда, объединившимися в Исламский альянс, кандидаты от «братьев» получили 37 мест. На выборах в 2005 году их независимые кандидаты имели уже 88 мест (20 % состава парламента) и образовали наибольшую по численности оппозиционную фракцию. На ноябрьских выборах 2010 года из-за прессинга властей «Братья-мусульмане» сильно просели, что привело к массовым акциям протеста сторонников движения и бойкоту голосования. Зато на выборах в декабре 2011 года партия одержала убедительную победу, набрав в первом туре 40 % голосов избирателей и победив во втором туре.
«Братья-мусульмане» стали ведущей политической силой в стране, пользующейся поддержкой народа. Поэтому закономерно, что в июне 2012 года представитель движения Мухаммед Мурси победил на первых президентских выборах в Египте. Сбылась мечта Хасана аль-Банны: созданное им религиозно-политическое движение демократическим путем пришло к власти. «Братья-мусульмане» правили Египтом год и один месяц. Их правление ознаменовалось тотальной исламизацией жизнеустройства. Повсеместно стали вводиться нормы шариата, начались нападения на коптские христианские церкви, а свергнутый президент Египта Хосни Мубарак попал в тюрьму, где ранее гноил «братьев». Начались политические чистки. Такое развитие событий перепугало старую египетскую правящую элиту, прежде всего высокопоставленных военных, которые начали опасаться за свою судьбу. И хотя новый президент Египта и его «братья» генералов пока не трогали, те понимали, что это только до поры до времени. «Братья-мусульмане» испугали городские образованные слои населения и бизнес, прежде всего крупный, и, наконец, они допустили ряд ошибок в экономической политике, которые ухудшили жизнь миллионов простых египтян.
Всё это породило недовольство новой исламской властью у верхов и низов египетского общества. В конце июня 2013 года на улицы египетских городов вышло около 30 млн человек с требованием отставки президента Мурси и ухода от власти «Братьев-мусульман». Ситуация грозила перерасти в гражданскую войну. Воспользовавшись этим, группа военных во главе с министром обороны и верховным главнокомандующим вооруженными силами генералом Абдул-Фаттахом Ас-Сиси 3 июля арестовала президента Мурси и совершила государственный переворот. Попытки сторонников «братьев» вернуть к власти свергнутого президента не увенчались успехом. Военные и поддержавшие их полиция и спецслужбы подавили массовые акции протеста и навели порядок.