После Второй мировой войны, из-за невозможности выехать из Болгарии и не желая расставаться с паствой, свят. Серафим остался под коммунистами. С 1946 г. он юрисдикционно подчинялся Русской Православной Церкви (юрисдикции Московской Патриархии). Много пришлось ему перенести унижений и притеснений в последующие годы, но и тогда свят. Серафим стоял на страже Православия. В значительной степени благодаря его трем докладам на Всеправославном московском совещании 1948 г. были осуждены экуменизм и масонство, выражено отрицательное отношение к новому календарному стилю.
Скончался свят. Серафим 13/26 февраля 1950 г. в Неделю торжества Православия. Похоронен он в Софии, при русской посольской церкви Св. Николая. Его могила стала местом паломничества верующих и совершения многих чудес. В тот же день в 2002 г. в Софии еп. Фотий Триадицкий совершил местное церковное прославление свят. Серафима, архиеп. Богучарского. Память святителя постановлено совершать 13/26 февраля.
§2. Сочинения
Все свои основные сочинения архиеп. Серафим написал будучи в эмиграции в Болгарии. Его сочинения можно разделить на догматико-полемические, нравственные и монархологические.
К догматико-полемическим сочинениям относятся: «Повое учение о Софии Премудрости Божией» (София, 1935 г.; Джорданвилль. 1993 г.), «Прот. С.П. Булгаков как толкователь Священного Писания» (София. 1936 г.; Джорданвилль, 1993 г.). «Защита Софианской ереси прот. С. Булгаковым пред лицом Архиерейского Собора Русской Зарубежной Церкви» (София, 1937 г.; Джорданвилль, 1993 г.), «Искажение православной истины в русской богословской мысли» (София, 1943 г.; Москва, 1997 г. – в сокращении), «Надо ли Русской Православной Церкви участвовать в экуменическом движении» (Доклад на Московском Всеправославном совещании 1948 г., «Церковный вестник», №13–15, 1948 г.; после перестройки доклад издавался в разных сборниках трудов свят. Серафима). «О новом и старом стиле» (Доклад на Московском Всеправославном совещании 1948 г., см. в сборнике «Краткое жизнеописание архиеп. Серафима (Соболева)», Фессалоники, 1991 г.).
К нравственным сочинениям можно отнести проповеди свят. Серафима, большая часть которых представлена в книге «Проповеди» (София, 1944 г.), а также в сборнике «Об истинном монархическом миросозерцании. Статьи и проповеди» (Санкт-Петербург, 1994 г.).
Учение о монархии в свете Священного Писания и свято-отеческих творений раскрыто в трудах архиеп. Серафима «Русская идеология» (София, 1939 г.; Джорданвилль, 1987 г.) и «Об истинном монархическом миросозерцании» (София, 1941 г.; также см. в одноименном сборнике «Об истинном монархическом миросозерцании. Статьи и проповеди», Санкт-Петербург, 1994 г.).
Для сочинений свят. Серафима характерно обильное использование ссылок на Священное Писание и Предание, в частности, на святоотеческие тексты и жития святых. Это неудивительно, так как, к примеру, двенадцать томом «Житий святых» свят. Димитрия Ростовского, свят. Серафим прочел за свою жизнь одиннадцать раз.
§3. Учение
1. В большинстве пунктов своего учения, свят. Серафим (Соболев) единомыслен с архиеп. Феофаном (Быстровым). Оба они должны быть признаны защитниками богословской традиции, сложившейся в русском школьном богословии к концу XIX – началу XX веков.
2. К догматике свят. Серафим обращается почти исключительно в контексте обсуждения острых богословских вопросов своего времени. Так, критикуя софианские воззрения В. Соловьева и священников Сергия Булгакова и Павла Флоренского, свят. Серафим раскрывает догматическое учение Церкви о Софии – Премудрости Божией как о Второй Ипостаси Троицы – Сыне Божием. По ходу дела здесь же он касается других разделов богословия, в частности, догмата иконопочитания и именологии, в обоих случаях отрицая «магический» взгляд на образ (видимый или звуковой) и настаивая на второстепенном значении образов, но сравнению с Первообразом.
Он также невзирая на лица критиковал частные богословские мнения группы богословов, выступивших в конце XIX – начале XX веков против схоластических перегибов в русском академическом богословии. Так, свят. Серафим выражает несогласие с иером. Тарасием (Курганским) и митр. Антонием (Храповицким), критиковавшими юридический подход к описанию догмата искупления, а также с митр. Сергием (Страгородским), утверждавшим, что правовое жизнепонимание не соответствует представлению о Боге-Любви. Критикует свят. Серафим и просоциалистические взгляды прот. П.Я. Светлова, а также уравнивание брачного и девственного состояний в богословии архиеп. Илариона (Троицкого).
3. Нравственное учение свят. Серафима просто и вместе с тем возвышенно. Он не только призывает к целомудрию, молитве, посту, кротости и смирению, но указывает на примеры из жизни Спасителя, Богородицы и святых. Не менее важно то, что свою нравственную проповедь святитель подкреплял примером собственной жизни.