Царь Б.Ф. Годунов скоропостижно умер от апоплексического удара в 1605 г., на престол вступил его 16-летний сын Федор. Царя Бориса Федоровича похоронили в Архангельском соборе Московского Кремля. Однако, когда царским престолом завладел Лжедмитрий I (Ю.Б. Отрепьев), труп царя Б.Ф. Годунова извлекли из царской усыпальницы Архангельского собора. Вдовствующую царицу Марию Григорьевну и юного царя Федора Борисовича Годунова убили. Останки царей Б.Ф. и Ф.Б. Годуновых и вдовствовавшей царицы (жены Б.Ф. Годунова) были похоронены в скромном Варсонофьевском монастыре в Москве. Но через год, когда царем стал Василий Иванович Шуйский, их останки по его приказанию торжественно перенесли в Троицкий монастырь и захоронили в западной паперти Успенского собора. А еще позже, в 1622 г., здесь была похоронена и многострадальная дочь Бориса Федоровича Годунова – красавица Ксения.