Митрополит Феогност благословил братьев и послал священников с антиминосом и мощами мучеников. В 1340 году церковь была освящена во имя Живоначальной Троицы.
Вскоре Стефан, не выдержав трудностей пустынножительства, ушел в московский Богоявленский монастырь, а Варфоломей остался в одиночестве
и продолжил свой подвиг пустынножительства. Однажды Варфоломей пригласил к себе жившего неподалеку игумена – старца Митрофана. Седьмого октября 1342 года Митрофан постриг Варфоломея в иноческий сан с именем Сергий – в тот день празднуется во имя святых Сергия и Вакха. После недели литургий и безвыходного молебна в «церковице» Сергий попросил у уходящего Митрофана благословления на отшельничество.Несколько лет он вел отшельнический образ жизни
. Затем молва о подвижнике распространилась, и к нему стали приходить люди, прося взять их к себе. Сначала Сергий, памятуя об участи своего брата, отговаривал людей. Но потом уступил и взял нескольких. В течение длительного времени их было двенадцать человек, и число это оставалось неизменным. Если кого-либо постигала кончина, тотчас же появлялся новый ученик. Было сделано двенадцать келий, их обнесли забором, и так возник монастырь, известный сейчас под названием Троице-Сергиевой лавры.В полночь начинались службы (полунощница), затем шла утреня – в три, шесть и девять часов. Вечером – вечерня. Между главными богослужениями – «молебные пения», молитвы в кельях, работа в огородах, шитье одежды, переписывание книг и иконописание. Из соседнего села приглашали священника – служить литургию.
Так постепенно Сергий превращался из пустынника в церковного деятеля
. Но священства еще не имел и игуменом не был. На просьбы братии стать их наставником отвечал, что желание стать игуменом – это властолюбие. Однако он решил, что этот вопрос решать должна церковная власть.В 1354 году Сергий с двумя старейшими из братии пешком отправился в Переславль-Залесский к заместителю митрополита
Алексия епископу Волынскому Афанасию, который поручил Сергию управление монастырем и рукоположил его в иеромонахи. Так преподобный Сергий стал игуменом основанной им обители
.Долгое время обитель Сергия Радонежского была чрезвычайно бедной
. В ней действовал «особножитный» устав: каждый инок рассчитывал на свои силы – не было ни общей трапезы, ни амбаров, ни кладовых. В 1372 году он получил в благословение от Константинопольского патриарха Филофея крест, параман и схиму. В своем письме патриарх советовал игумену Сергию ввести в обители общежительский устав.Было сделано двенадцать келий, их обнесли забором, и так возник монастырь, известный сейчас под названием Троице-Сергиевой лавры.
С того момента жизнь монастыря начала перестраиваться. Все имущество стало общим; были построены амбары, кладовые, хлебопекарни. Для братии был назначен общий духовник. Одним из первых духовников был преподобный Савва – основатель Саввино-Сторожевского монастыря в Звенигороде.
Однако далеко не всем монахам нравились новые порядки. Увидя, что «оппозиция» не сдается, отец Сергий молча покинул обитель и на пустынном месте у реки Киржач основал новую обитель в честь Благовещения Пресвятой Богородицы
. Однако через четыре года по горячей просьбе братии Троицкого монастыря и совету самого митрополита Алексия преподобный Сергий вернулся в свою первую обитель, оставив настоятелем нового монастыря преподобного Романа Киржачского.Скорее всего, соблюдение устава в Троицком монастыре держалось не на страхе наказания, а на высочайшем авторитете игумена Сергия, его могучей духовной силе и обаянии. Он стремился убедить своих учеников – как словом, так и, прежде всего, собственным примером, в первую очередь полной самоотдачей Господу. Сергий был не проповедником, но делателем веры Христовой в сердцах людей.