Гернштадт в это время находился в Москве и занимался аналитической работой: он анализировал всю оперативную информацию по Германии и составлял справки для начальника ГРУ. Ветеран советской военной разведки В.В. Бочкарев, лично знавший Гернштадта, вспоминал: «В течение всего периода работы на германском участке 1-го отдела мне приходилось постоянно встречаться по заданию начальника ГРУ И.И. Ильичева с Рудольфом Гернштадтом, замечательным разведчиком, создавшим берлинскую резидентуру, завербовавшим семь ценных агентов, включая Ильзе Штёбе, Герхарда Кегеля, Курта Велкиша и других. Несколько месяцев я проживал с ним на одной служебной квартире. От Р. Гернштадта было получено более 20 разработок и справок на военно-политические темы, связанные с фашистской агрессией, включая битвы под Москвой, Сталинградом и на Курской дуге. В ноябре 1942 года он подготовил обстоятельный и объемный документ, касающийся организации нелегальной работы в Германии»[326]
.После формального роспуска Коминтерна в мае 1943 г. его сотрудники и структуры были переданы в ЦК ВКП(б), под руководством которого был создан «Институт 99»[327]
, готовивший создание будущего германского антигитлеровского правительства – Национального комитета «Свободная Германия» (НКСГ). На учредительной конференции НКСГ 12 июля 1943 г. в подмосковном Красногорске был принят программный манифест, текст которого по заданию члена ЦК ВКП(б), секретаря ИККИ и члена Совета военно-политической пропаганды при Главном политуправлении Красной Армии Д.З. Мануильского написали немецкие коммунисты – журналист Рудольф Гернштадт и писатель Альфред Курелла, избранные членами НКСГ.