Декарт собирался, но так и не успел написать части трактата, посвященные природе растений и животных и природе человека. Понимая, что может не успеть, он решил в этой части книги изложить некоторые свои мысли о природе человека, которые намеревался позже раскрыть подробнее. Частично эти идеи Декарт рассмотрел в отдельном сочинении: «Описание человеческого тела. Об образовании животного».
Поэтому следует заметить, что, хотя человеческая душа и соединена со всем телом, основные свои функции, однако, она выполняет в мозгу. При посредстве мозга она не только постигает и воображает, но и ощущает; последнее происходит при помощи нервов, которые наподобие тончайших нитей тянутся от мозга ко всем частям прочих членов тела, причем связаны с ними так, что нельзя прикоснуться почти ни к какой части человеческого тела, чтобы окончания нервов не пришли тем самым в движение и чтобы это движение не передалось посредством нервов до самого мозга, где находится объединяющее чувствилище (Sens commun), как я с достаточной обстоятельностью изложил в четвертой главе «Диоптрики». Движения, передаваемые таким образом нервами, доходят до того места в мозгу, с которым наша душа тесно связана и соединена, и внушают ей различные мысли в зависимости от различия самих движений. И эти-то различные мысли нашей души, вытекающие непосредственно из движений, возбуждаемых через посредство нервов в нашем мозгу, собственно, и именуются ощущениями или, иначе, восприятиями наших чувств.
Хотя душа присутствует во всем теле, ее взаимодействие с телом должно соответствовать физиологическому строению нервной системы, функционирование которой обеспечивает мозг. Поэтому взаимодействие души с телом осуществляется через мозг. Он принимает сигналы от органов ощущений и сообщает их душе, которая воспринимает их в виде чувственных ощущений.