Однако в последние годы появились некоторые противоположные оценки деятельности Андропова, основанные на неопубликованной рукописи воспоминаний бывшего первого секретаря ЦК КП(б) КФССР, члена Военного совета 7‑й армии, генерал-майора Геннадия Николаевича Куприянова под названием «Партизанская война на Севере», в которой он упрекает Андропова, например, в том, что тот якобы сам не просился за линию фронта или в подполье. При этом следует учитывать, что Куприянов написал это после того, как он, опытный партийный руководитель, в 1938 году являвшийся членом «тройки» в Карелии, утверждавшей расстрельные списки, был осужден по «Ленинградскому делу» и находился в заключении с 1950 по 1956 год, а затем был назначен директором дворцов и парков в Пушкине. Так что его зависть и обида к Андропову, никогда не принадлежавшему к ленинградской партийной группировке, понятны. И все же тот же Куприянов в январе 1970 года написал в Москву в Политиздат: «В ходе войны имена, клички подпольщиков и задания, которые они получали при заброске в тыл врага, знали только три человека — И.В. Власов, Ю.В. Андропов (он был тогда секретарем ЦК ЛКСМ КФССР) и я…»
Удивительный факт, но за годы войны зафиксирован лишь один факт предательства со стороны карельских комсомольцев-подпольщиков. По оценке Николая Тихонова, инструктора военного отдела ЦК ЛКСМ республики, «потребность в исчерпывающем знании проблемы, подлежащей решению, деловитость и принципиальная настойчивость уже тогда были присущи Юрию Владимировичу в высшей мере. Действия его при всей основательности были стремительными, умение перестроиться в нужный момент — поразительным» («Чекисты Карелии», 1986 год).
Партизанский опыт Андропова очень помог ему в ходе подавления фашистского мятежа в Венгрии в 1956 году — первой «цветной революции», спланированной западными спецслужбами (операция «Фокус»). В тот момент командующий группировкой советских войск на территории Венгрии — Особым корпусом, прикрывавшим границу с Австрией, Герой Советского Союза генерал-лейтенант Пётр Николаевич Лащенко полагал, что в сложившейся обстановке наши войска не должны вмешиваться в ситуацию. Чрезвычайный и Полномочный Посол СССР в Венгерской Народной Республике Юрий Владимирович Андропов, находившийся в Венгрии с 1953 года и имевший опыт партизанской войны, был иного мнения: «Что, оставим народную власть, коммунистов и патриотов на растерзание?» Лащенко ответил, что пусть они сами защищают себя и свою власть. «Мы не должны за них воевать. Кто желает, пусть уходит с нами». «Советские войска уйдут, — сказал Андропов, — а завтра здесь будут США и их союзники. Надо разгромить в Будапеште вооруженные отряды мятежников, и все здесь успокоится».
При этом Андропов опирался и на мнение полковника Григория Фёдоровича Григоренко, сотрудника легендарного ГУКР «Смерш», участника радиоигр с гитлеровскими спецслужбами, который в марте 1954 года был командирован в Венгрию в качестве заместителя старшего советника КГБ при СМ СССР.
Здесь стоит отметить, что на языке чекистов группы разведчиков, работающие в тылу недружественных государств, назывались резидентурами, во главе которых стоял резидент. А вот аналогичные структуры на территории стран-союзников назывались представительствами, во главе которых находились старшие советники. При этом задачи резидентуры и представительства решали разные. Первые осуществляли разведывательную деятельность против вероятного противника, в том числе и нелегальную, тогда как представительства в основном консультировали дружественные органы госбезопасности, а по сути создавали их заново.
Старшим советником КГБ в Венгрии был полковник Георгий Авксентьевич Ищенко. До этого с марта 1953 года он возглавлял 3‑й отдел (агентурно-оперативная работа по интеллигенции) 4‑го (секретно-политического) управления МВД СССР. Заместителем начальника этого управления был генерал-майор Георгий Валентинович Утехин, в годы войны начальник 3‑го (розыск) и 4‑го (зафронтовой) отделов ГУКР «Смерш». Старшим оперуполномоченным 2‑го отделения 3‑го отдела ГУКР «Смерш» был Григорий Фёдорович Григоренко.
Среди всех сотрудников представительства наибольшим опытом работы за рубежом обладал ещё один заместитель старшего советника КГБ в Венгрии полковник Елисей Тихонович Синицын, который в 1943–1945 годах был заместителем резидента и резидентом НКГБ СССР в Финляндии.
В годы Второй мировой войны Венгрия фанатично сражалась на стороне Германии, которая, по мнению венгров, помогла им смыть национальный позор. Напомним, что после Первой мировой войны в результате навязанного ей странами-победительницами Трианонского мирного договора Венгрия лишилась 72 % своей территории (включая Трансильванию, Хорватию, Словакию и Карпатскую Русь) и 64 % населения (включая 3 млн этнических венгров), выхода к морю и флота, 88 % лесных ресурсов, 83 % производства чугуна и 67 % банковско-кредитной системы. Поэтому реваншизм, который накладывался на радикальный мадьярский национализм, стал идеологической основой диктатуры Миклоша Хорти.