Разгром в январе 1919 года антисоветского мятежа, организованного в Ташкенте «левыми» эсерами и английской агентурой, и восстановление 22 января прямой связи с Российской республикой укрепили положение Советской власти в Туркестане. Трудящиеся Туркестана получили большую помощь от ЦК РКП(б) и правительства РСФСР.
2 февраля Совнарком РСФСР принял постановление о снабжении Туркестана продовольственными и промышленными товарами. Для нужд Советского Туркестана было выделено 12 миллионов пудов хлеба, большое количество чая, сахара, текстильных товаров, а также сельскохозяйственных машин. По указанию правительства РСФСР из Москвы и других городов в Туркестан еженедельно отгружалось 45 вагонов различных товаров и 30 вагонов хлебных грузов. В Ташкент направлялось значительное количество оружия, боеприпасов и снаряжения 12 февраля ЦК РКП(б) и Совнарком РСФСР создали «Особую Комиссию СНК по делам Туркестана» в составе П. А. Кобозева, Ш. 3. Элиава и А. С. Киселева. На Комиссию была возложена организация всесторонней помощи Туркестану, надзор за точным и своевременным исполнением в Туркестане декретов и постановлений Совнаркома. ЦК РКП(б) поручил также Комиссии оказывать помощь партийным организациям Туркестана в их работе. Из членов Комиссии в Ташкент удалось приехать лишь И. А. Кобозеву, остальные члены Комиссии находились в Оренбурге.
Большое значение для дальнейшей борьбы трудящихся Туркестана с внутренней контрреволюцией и интервентами имели VII съезд Советов Туркестана и II конференция Коммунистической партии Туркестана, происходившие в марте 1919 года.
VII Чрезвычайный съезд Советов Туркестана (7—31 марта) обсудил военный вопрос, вопрос о советском строительстве и финансовом положении Республики. Решения съезда были направлены на ликвидацию проявлений партизанщины в армии, на укрепление дисциплины, на организацию сил для беспощадной борьбы против контрреволюции. На заседаниях национальной секции съезда, проходивших с участием П. А. Кобозева, обсуждались вопросы привлечения трудящихся местных национальностей к советскому строительству и к работе по укреплению Красной Армии. Съезд выразил протест англо-американским империалистам — организаторам интервенции в Советской России. На основе решений VII съезда Советов в Республике стали создаваться комбеды и земельно-водные комитеты, были организованы центральные заготовительные органы.
II конференция Коммунистической партии Туркестана (19–31 марта) уделила большое внимание партийной работе среди местного населения. С этой целью конференция решила создать Мусульманское бюро (Мусбюро) при красном комитете партии. В дальнейшем было утверждено Положение о Мусбюро как вспомогательном органе при крайкоме для пропаганды коммунистических идей среди трудящихся мусульман. Мусбюро и его отделы на местах вели большую работу среди трудящихся коренного населения, мобилизуя их на активное участие в советском строительстве, на борьбу с контрреволюцией.
Конференция приняла решение о мобилизации в Красную Армию 25 процентов большевистской организации Туркестана. Особое значение имело решение конференции о развертывании партийно-политической работы с войсках. Конференция обязала крайком партии создать в воинских частях Туркестанской республики аппарат военных комиссаров, возложив на него политическое воспитание красноармейцев и укрепление дисциплины. При политотделе Реввоенсовета Туркестанской республики была создана Мусульманская секция для ведения политической работы среди бойцов узбеков, таджиков, казахов, туркмен и киргизов. Конференция также рекомендовала создать органы партийной печати в армии; вскоре начала выходить газета «Красный фронт» — орган политотдела Реввоенсовета Туркестанской республики.
Решения VII съезда Советов и II партийной конференции способствовали дальнейшему сплочению трудящихся вокруг Коммунистической партии и Советской власти, что явилось важнейшим условием успешной борьбы на фронтах Туркестана.
Военное положение Советского Туркестана в начале 1919 года улучшилось. Силы Красной Армии Туркестана, действовавшей на нескольких фронтах, выросли. Войска на актюбинско-оренбургском направлении после соединения с Восточным фронтом подверглись значительной реорганизации. Из них была создана Туркестанская армия, вошедшая в состав Восточного фронта.