9 августа 2006 года Московский окружной военный суд признал его виновным в совершении особо тяжкого преступления — государственной измены в форме шпионажа в пользу спецслужб Великобритании и вынес обвинительный приговор. Предателю было назначено наказание в виде лишения свободы сроком на тринадцать лет. Он также был лишен воинского звания — полковник и всех государственных наград.
Свой срок Скрипаль не отсидел до конца. 9 июля 2010 года он был помилован президентом России Д. Медведевым. В тот же день Скрипаля вместе с Игорем Сутягиным, Александром Запорожским и Геннадием Василенко, также осужденных за государственную измену, в аэропорту Вены обменяли на десять российских разведчиков-нелегалов, разоблаченных в США. Их выдал, сбежавший на Запад бывший офицер Службы внешней разведки А. Потеев.
Покинув Россию, Скрипаль обосновался у своих хозяев — МИ-6, в Британии и кормился на свои «тридцать сребреников», рассчитывая дожить до глубокой старости. Он не подозревал, что коварные политики с Даунинг-стрит, 10 готовили его для следующего этапа большой игры с Россией.
Постаревший шпион, видимо, потерял нюх и не почувствовал угрозы, исходившей от Идальго-Миллера. Случайно или нет, тот зачастил в Солсбери. Причину такого интереса к отставному шпиону могли бы объяснить в МИ-6, но вряд ли они это когда-нибудь сделают. Британские спецслужбы, как правило, не размениваются на сиюминутные результаты. Их операции носят долговременный характер и преследуют масштабные, зачастую политические цели. Одной из них — дискредитации России, по замыслу политиков с Даунинг-стрит, 10 и должен был послужить отставной шпион.
К 2018 году Скрипаль, потеряв близких людей, всё больше ощущал себя брошенным человеком. Чуждый менталитет чопорных британцев и чужая страна, которой он продал родину своих родителей, тоска и, вероятно, угрызения совести опустошали душу. По ночам, в пустых комнатах ему чудились призраки тех, кого он предал. Страх, возможно, раскаяние перед неминуемой расплатой на Высшем суде, неподвластном звону злата, изводил Скрипаля.
В редкие приезды дочери и в телефонных разговорах с теми немногими, кто отвечал на звонки из России, он сетовал на превратности судьбы. Нет сомнений в том, что терзания Скрипаля не составляли тайны для британских спецслужб. Бывшие агенты, тем более такого уровня, никогда не остаются без контроля.
В телефонных беседах с российскими знакомыми Скрипаль, говоря о возможном возвращении на родину, проявлял поразительную наивность. Свою роль сыграли расстроенная ударами судьбы психика и возраст — 67 лет. Нельзя исключать и того, что он посчитал шпионскую игру навсегда оконченной, и ошибся. МИ-6 играет в долгую игру и не знает пощады, когда речь идет об интересах Британии.
Об этом, еще 150 лет назад, 1 марта 1858 года, выступая в Палате общин, говорил лорд Г. Палмерстон.
При этом он, не без горечи, сожалел:
В те годы, когда солнце не заходило над могущественной Британской империей, ее политики могли позволить себе послать флот или экспедиционный корпус, чтобы усмирить восставших сипаев в Вест-Индии, либо подарить мешок стеклянных побрякушек, чтобы подкупить вождя воинственных гуронов в Северной Америке. Те времена для Британии навсегда остались в прошлом. Нынешние властители кабинетов на Даунинг-стрит, 10 не хотят мириться с этим. Они, как и их предшественники, продолжают плести международные интриги и заговоры, создают и выпускают в мир фейковые новости.
Весной 2018 года брексит, подобно дамоклову мечу, навис над головой незадачливого правительства премьер-министра Т. Мэй. «Непричесанный» министр иностранных дел и любитель летать на воздушных шарах — Б. Джонсон, почувствовав, что пахнет жареным, скорехонько сдулся. Вслед за ним, подобно крысам, бегущим с тонущего корабля, ушла в отставку чертова дюжина министров. Отчаявшись сохранить на плаву правительство консерваторов и себя любимую, Мэй, как это уже не раз случалось с британскими политиками, решила бросить на международный стол «дохлую кошку». В качестве таковой оказались отставной шпион Скрипаль и его несчастная дочь Юлия.
За дело, в чем нет сомнений, взялась британская спецслужба. В политической ситуации 2018 года, сложившейся в Великобритании вокруг правительства Мэй, возвращение Скрипаля в Россию было бы равносильно второму брекситу. То, что такие мысли у отставного шпиона возникали всё чаще, подтверждал его однокашник по школе В. Тимошков. В частности, в интервью телеведущей НТВ И. Зейналовой, — оно вышло на телеэкраны 30 сентября 2018 года в программе «Итоги недели», — он рассказал: