Ещё одним важным шагом на пути к демократии было осуждение режима «чёрных полковников» с целью предотвращения возможности повторного военного переворота. Военные всегда играли серьёзную роль в жизни греческого общества, однако после семилетнего периода правления «чёрных полковников» значение армии приобрело негативный окрас. Если раньше военные ассоциировались у греков с защитой и безопасностью, теперь они вызывали страх и недоверие. Необходимо было принять кардинальные меры, чтобы ситуации, подобные перевороту 21 апреля 1967 года, больше не повторились. Для этого нужно было отстранить военных от власти, «вернуть их в казармы». Такая цель стояла перед гражданским правительством, и она была не так проста в исполнении. Прежде всего, опасность обострения взаимоотношений между военными и гражданскими властями требовала осторожности в проведении необходимых мер.
19 августа 1974 года был собран Высший совет национальной обороны (ВСНО) Греции под председательством премьер-министра К. Караманлиса. Десять генералов из числа высшего командного состава были отправлены в отставку. На их место призывались представители греческого генералитета, снятые с постов в период военного режима 1967–1974 гг.[302]
. Таким образом, новое гражданское правительство дало понять, что может сохранять контроль над политической ситуацией. Кадровые перестановки и отставка генералов произошли менее чем через месяц после начала работы Правительства национального единства, что подтверждает решимость гражданских властей как можно скорее наладить политическую ситуацию в стране. И в то же время чистки в вооружённых силах растянулись на длительный срок, так как сохранялась напряжённость в отношениях Греции с Турцией. В октябре 1974 года начались процессуально-судебные мероприятия против руководства военного режима. При этом расследование обстоятельств и последствий военного переворота 21 апреля 1967 года поручалось не гражданским чиновникам, а военным, в частности главнокомандующему вооружёнными силами генералу Д. Арбузису. 21 октября 1974 года были выдвинуты обвинения против бывшего диктатора Г. Пападопулоса, генерала Д. Иоаннидиса (бывшего начальника военной полиции), генерала М. Руфогалиса (бывшего начальника Центральной службы информации КИП), генерала Д. Загоринакоса (бывшего главнокомандующего вооружёнными силами), а также ещё против тридцати бывших офицеров ВС и полиции. 23 октября 1974 года были арестованы и сосланы на остров Кея бывшие руководители военного режима и переворота 21 апреля: Г. Пападопулос, Ст. Паттакос, Н. Макарезос, И. Ладас и М. Руфогалис[303].За действиями Правительства национального единства в отношении военных следила как греческая, так и зарубежная пресса. Например, американская газета «Нью-Йорк таймс» отметила, что премьер-министр Константинос Караманлис не спешит с процессом наказания участников переворота 21 апреля 1967 года. Так, первоначально он изолировал лидеров Хунты, чтобы предоставить дело в руки правосудия и правительства, которое должно быть выбрано 17 ноября 1974 года. Также было заявлено, что нетерпение пострадавших от Хунты понятно, однако вынесение приговора для каждого из виновных должно быть оставлено на усмотрение судов.[304]