В это же время возводится большинство каменных сооружений в Борисоглебском монастыре. Постройки эти не были безымянными.
Они воздвигались под руководством талантливых русских зодчих: «государева мастера» Андрея Малого и ростовского каменных дел мастера Григория Борисова. Грозный укреплял монастыри, делал в них большие «вклады», преследуя этим различные цели, одной из которых было усиление обороны незащищенного города. В окрестностях Ростова стояли монастыри: в восточном направлении (к Ярославлю) Авраамиевский, Петровский, Белогостицкий; на севере - Варницкий, в западном направлении к Москве - Спасо-Яковлевский, Спас-Песоцкий. По дороге на Углич - Борисоглебский монастырь. Это были монастыри-крепости.
Польско-литовская интервенция.
Но когда в начале XVII века началась польская интервенция, эта «оборона» оказалась ненадежной. Отряды «тушинского вора» - Лжедимитрия II под предводительством Сапеги и Лисовского в октябре 1603 года без труда захватили Переславль-Залесский. Они двинулись дальше к Ростову. На подступах к городу их встретила ростовская рать, возглавляемая воеводой Третьяком Сеитовым. Ростовцы сражались мужественно, но хорошо вооруженные и обученные отряды шляхты и казачества разбили рать и ворвались в город, предав его огню и мечу. С бою был взят последний оплот ростовцев - Успенский собор, где укрылись женщины, дети, старики вместе с митрополитом Филаретом Никитичем Романовым, призывавшим быть твердыми перед лицом смертельной опасности. Со словами вразумления обратился он к ворвавшимся врагам, но никому не было пощады, и все искавшие защиты в храме были перебиты.Филарет взят в плен и отправлен в Тушино, ценности собора разграблены.
Народ поднялся на борьбу с врагом. Народное ополчение, сформировавшееся в Нижнем Новгороде, пришло в Ярославль, количественно выросло и двинулось к Москве. В Ростове к шедшим примкнули ростовские ратники.
Ополчение, возглавляемое Мининым и Пожарским, разбило интервентов и очистило от них столицу в октябре 1612 года. Страшную картину полного разорения представлял Ростов после польско-литовской интервенции. Вскоре была проведена в городе перепись населения, учет земель и строений. Нередки были записи, подобные этой: «
Строили эти укрепления три года, выполняя государственную повинность, жители Ростова, Кинешмы и Пошехонья. В работах постоянно принимали участие 1000 человек, возивших землю на тачках и на конных двухколесных подводах. Руководил работами военный инженер голландец Ян Корнилиус Роденбург. По тому времени это были мощные фортификационные сооружения. К счастью, они не использовались по назначению.
Центр города.
На месте, где строились валы было снесено много частных и государственных зданий (например, здание острога). С тех пор определился современный центр города как территория, окруженная валами, то, что оказалось огорожено («огородить», «город» - слова одного корня).Валы
В речи местного населения и сейчас бытуют выражения: «иду в город», «встретимся в городе» - значит, в центре. Понятие это сложилось исторически, и такие фразы следует считать правильными. Валы, определив центр города, отделили его от посада. В центре города по-прежнему стояли Успенский собор и церковь Спаса на Торгу, она же Спас Ружная (руга - особый сбор, пожертвования). Рядом - Гостиный двор, обнесенный забором. На большой торговой площади правильными линиями тянулись ряды: калачный, сапожный, рыбный, мясной и другие.
Значительное место занимала торговля зерном. Здесь же стоял и двор кабацкий.