К тому времени Игнасио Лопес Район, обосновавшийся с июня 1811 г. в Ситакуаро, выступая как преемник Идальго, предложил образовать руководящий орган восстания. Эту идею одобрили Морелос и другие лидеры патриотов, сознававшие необходимость создания такого центра. 19 августа Район созвал зажиточных горожан и окрестных землевладельцев, которые приняли решение об учреждении Верховной национальной хунты Америки во главе с Районом. В состав ее вошли также Хосе Мария Лисеага, священник Хосе Систо Вердуско, а в дальнейшем и Морелос. Хунта поддерживала связь с упоминавшейся выше тайной организацией «Лос Гуадалупес». Видную роль в деятельности ситакуарской хунты играли священник Хосе Мария Кос, который с мая 1812 г. начал выпускать еженедельник «Илюстрадор американо», и Кинтана Роо, издававший еженедельник «Семанарио патриотико американо».
Подобно Альенде и его единомышленникам, хунта выражала интересы тех креольских помещиков и купцов, которые не перешли на сторону колонизаторов и, оставшись в революционном лагере, составили умеренное правое крыло освободительного движения. Район и его окружение придавали решающее значение чисто военным факторам и явно склонялись к компромиссу с испанскими властями при условии некоторых политических и экономических уступок имущим классам. Не заявляя открыто или лишь в общей форме упоминая о том, что патриоты добиваются независимости, ситакуарская хунта настойчиво подчеркивала свою лояльность по отношению к Фердинанду VIL Об этом Район и Лисеага еще 22 апреля писали Кальехе, предлагая созвать Национальный конгресс, что привело бы, по их словам, к прекращению революционного движения. В письме Морелосу от 4 сентября члены хунты указывали, что последняя по «тактическим соображениям» должна выступать от имени Фердинанда VII, ибо это поможет ей привлечь на свою сторону тех креолов, которые чувствуют себя связанными присягой «законному» монарху{63}
. Этого принципа они упорно придерживались во всех документах.Деятельность хунты характеризовалась колебаниями и непоследовательностью, отсутствием четкой политической платформы, игнорированием коренных экономических и социальных проблем, волновавших широкие слои населения. Этим главным образом и объяснялось то, что, претендуя на руководство восстанием, она не пользовалась авторитетом у большинства патриотов, а многие партизанские командиры вообще отказывались подчиняться ей, Морелос и его сторонники, представлявшие радикальное крыло освободительного движения, решительно возражали против того, чтобы провозглашать целью борьбы восстановление власти Фердинанда VII. Они выдвигали также ряд политических и социально-экономических требований, не находивших отклика у ситакуарской хунты.
Из-за споров с руководителями хунты Морелос практически не участвовал в ее деятельности. Продолжая собирать патриотические силы на юге страны, он установил связи с другими революционными центрами и партизанскими отрядами. В середине ноября 1811 г. Морелос активизировал свои действия. Он занял Тлапу, вслед за тем штурмом овладел Чаутлой и направился дальше на север. Нанеся поражение преградившим ему путь испанским войскам, Морелос 25 декабря вступил в Куаутлу, после чего пошел на соединение с отрядом Галеаны, занявшим Таско. В конце года повстанцы захватили важный административный и торговый центр Теуакан.
Армия Морелоса насчитывала в то время около 9 тыс. человек. Большую часть ее составляла пехота, состоявшая из девяти полков. Кроме того, командование располагало резервом в количестве восьми отборных рот, которые бросало на самые ответственные участки. В его распоряжении имелись также кавалерийские формирования. Бойцы Морелоса отличались мужеством, выносливостью, дисциплинированностью, преданностью своему делу и стойкостью в сражении. Они были кое-как одеты и обуты, а многие даже полураздеты, но зато неплохо обучены и вооружены трофейным огнестрельным и самодельным холодным оружием.
В последние месяцы 1811 г. патриоты и в других районах добились новых успехов и значительно расширили сферу боевых операций. Хотя крупные города, в том числе портовые, находились под контролем роялистов, за пределами их действовали партизаны, постоянно угрожавшие этим центрам, особенно когда их оставляли испанские войска. В конце ноября 12-тысячный отряд Альбино Гарсии атаковал Гуанахуато. Потерпев неудачу, повстанцы все же сохранили свои позиции в окрестностях города.
В соседнем Мичоакане единственным населенным пунктом, который прочно удерживали испанцы, оставался Вальядолид. Не прекращались бои вокруг превращенного в крепость Керетаро. Связь между этим городом и столицей вице-королевства была нарушена.