К концу кампании разнородные броненосные корабли научились удерживаться в строю. Среди моряков распространялся дух любви к делу и соревновательности. Летом 1868 года флагман усложнил подготовку. Две канонерские лодки переоборудовали в суда для таранных учений. Исходя из требований боя, Бутаков считал необходимым учить соответственно артиллеристов. В приказе он писал: «Будем же гоняться не за тем, чтобы в отчетных ведомостях о пальбе у нас стояли высокие проценты попавших ядер, а употребим все усилия, чтобы пальба подходила возможно более к тем условиям, которые предстоят в действительном бою, т. е. будем стрелять с неопределенных заранее дистанций и в движущиеся предметы»1494
.Артиллеристы успешно стреляли с ходу по неподвижным треугольным щитам, учились попадать в щиты движущиеся. Когда в 1870 году на вооружение поступили нарезные орудия, Бутаков ввел стрельбу на качке1495
. Моряков учили плавать. Флагман на переходах между портами проводил эволюции эскадры, действуя как в военном крейсерстве. Комиссия под командованием адмирала Е.В. Путятина высоко оценила двухлетнюю его деятельность по подготовке эскадры: «Начальник броненосной эскадры вице-адмирал Бутаков 1 глубоко понял назначение и будущую роль вверенных ему судов и не упустил с расчетом и необыкновенным умением воспользоваться всеми находящимися в его руках средствами и каждой минутой времени для приведения как судов броненосной эскадры, так и команд на них находящихся, к возможному совершенству»1496.В первый месяц кампании 1869 года Бутаков практиковал «крейсерства» на рейде, при котором суда, двигаясь полным ходом, по очереди огибали суда, стоявшие на рейде, выписывая сложные восьмерки. Затем флагман добивался слаженности в маневрах отрядов однотипных судов1497
.29 января 1868 года Бутакова назначили старшим флагманом Балтийского флота. 1 января 1869 года ему пожаловали аренду по 2000 рублей на 12 лет. А 3 июля 1869 года на Транзундском рейде проходил высочайший смотр флоту, и довольный Александр II пожаловал моряку звание генерал-адъютанта со следующими словами: «Я тебя благодарю прежде всех и поздравляю моим генерал-адъютантом. Я уверен, что ты останешься таким, каким я тебя всегда знал». По повелению Императора Бутакова командировали на Черное море. Затем, в 1870—1876 годах, вице-адмирал командовал броненосной эскадрой в финляндских шхерах и Балтийском море. В 1871 году он был удостоен ордена Св. Владимира II степени, 1 января 1874 года — ордена Белого орла, в 1875 году получил прусский орден Красного орла I степени и шведский орден Меча1
.Не всегда все обходилось гладко. Из-за технических недостатков судов летом 1869 года при повороте броненосная батарея «Кремль» протаранила фрегат «Олег», быстро затонувший. Только решительные действия экипажа спасли получившую пробоину броненосную лодку «Русалка». Потому Бутаков поддержал предложения лейтенанта С.О. Макарова иметь на кораблях готовые пластыри и оборудовать трюмы водоотливной системой труб. Уже летом 1870 года предложенный Макаровым пластырь применили при спасении парохода «Ильмень». Бутаков поддерживал новаторскую деятельность офицеров, которые занимались усовершенствованиями в разных отраслях морского дела, и успехи изобретателей отмечал в приказах. При нем были испытаны и одобрены механический привод штурвала, «стволики» в стволах крупнокалиберных орудий для удешевления учебных стрельб1498
1499.Сам вице-адмирал нередко предлагал усовершенствования. Он немало занимался минным делом. В 1867 году на эскадре Бутаков организовал временную школу минеров. С 1868 года на специально оборудованной канонерской лодке проводили опыты с подведением мины под дно неприятельского корабля. Параллельно испытывали первые образцы трала. Занимавшийся минным делом лейтенант В.А. Терентьев зимой читал курс лекций офицерам, чем предвосхитил минные офицерские классы, созданные в Кронштадте через несколько лет. Деятельность Бутакова по исследованию возможностей минного оружия была оценена комиссией Путятина. В кампанию 1869 года моряки продолжили опыты с применением шестовых мин. Осенью вице-адмирал основал минную школу для офицеров, в первую очередь добровольцев. С кампании 1870 года учения с атаками минных катеров на броненосцы стали систематическими. С 1873 года для отражения минных атак начали применять введенные Бутаковым на некоторых кораблях электрические прожекторы. В 1874 году на.флоте учредили должность заведующего минной частью, а 1 октября — Минные офицерские классы и Минную школу для матросов. Во многом это явилось заслугой Г.И. Бутакова1
.По проекту Бутакова в 1874 году на броненосном фрегате «Петропавловск» установили по бортам десять четырехфунтовых пушек на станках, позволяющих стрелять по атакующим миноносцам. Фрегат стал первым в мире кораблем с противоминной артиллерией1500
1501.