На место отправившейся от берегов Англии в Средиземное море для усиления Ф. Ф. Ушакова эскадры вице-адмирала П. К. Карцова и отряда контр-адмирала М. И. Борисова, ушедшего в Ревель, из Архангельска для соединения с русским флотом, находившимся в Северном море, была направлена эскадра вице-адмирала Б.А. Баратынского в составе трех 74 пушечных линейных кораблей: «Ярослав» (капитан 2 го ранга И.А. Баратынский 4 й), «Москва» (капитан 1 го ранга Г.А. Сарычев), «Св. Петр» (капитан 2 го ранга Е.И. Лутохин), двух фрегатов – «Тихвинская Богородица» (капитан 2 го ранга К. А. Абернибесов), «Феодосий Тотемский» (капитан-лейтенант Р. П. Шельтинг).
8 сентября 1799 г. эскадра под флагом вице-адмирала Б. А. Баратынского вышла в море. 11 сентября суда обогнули Св. Нос и вышли в океан. 2 октября в шторм корабли потеряли друг друга и далее шли самостоятельно. Все они получили серьезные повреждения.
На корабле «Ярослав» ослаб такелаж, сломались все три мачты, треснуло перо руля, затем переломился верхний румпель. Дальше корабль шел на буксире английского транспортного судна, а затем английского фрегата «Чампион». 17 ноября «Ярослав» был приведен на Литский рейд.
Корабль «Москва», прождав три дня, пошел к Эдинбургу, опрашивая встречные суда об эскадре. 21 октября он прибыл на Литский рейд. Затем перешел на Ярмутский рейд, а 19 ноября – в Блестекс, где остался до января 1800 г.
На корабле «Св. Петр» раскололся руль, сломались три мачты и бушприт. Вода в трюме поднялась почти на метр, ее непрерывно откачивали. На корабле поставили фальшивое вооружение. 21 октября корабль приблизился к Норвежскому берегу. Выдержав еще один сильный шторм, корабль 15 ноября прибыл в Берген и закончил кампанию.
На фрегате «Тихвинская Богородица» 2 октября из-за ветра и качки ослаб такелаж, в итоге сломались все три мачты, затем выворотило с места бушприт, при этом погиб один матрос. На следующий день поставили фальшивое вооружение на обломках мачт. 29 октября фрегат пришел на Литский рейд. В декабре начался ремонт судна.
У фрегата «Феодосий Тотемский» 1 октября во время шторма переломилась фок-мачта и бушприт, затем грот-мачта. К остаткам мачт поставили стеньги и фальшивое вооружение. 14 октября фрегат пришел к Норвежским берегам, а затем направился к Шотландским берегам. 23 октября пришел на Норский рейд. 11 ноября фрегат перешел в Блекстекс, где оставался до января 1800 г.
К концу года русские суда собрались в английских базах. Наиболее поврежденные были поставлены в доки на ремонт. С июля по сентябрь 1800 г. русские корабли, совместно с английскими, крейсировали в Северном море, блокируя голландские берега.
16 сентября было получено Высочайшее повеление – возвращаться в Россию. «Александру Невскому» приказано из-за ветхости идти в английский порт на соединение с эскадрой М. К. Макарова, контр-адмиралу К.Е. фон Брейеру с остальными судами идти в Россию.
В начале 1800 г. в портах Англии находились 14 кораблей («Елисавета», «Всеволод», «Мстислав», «Болеслав», «Ретвизан», «Иона», «Александр Невский», «Северный Орел», «София-Магдалина», «Св. Петр», «Европа», «Иануарий», «Михаил», «Эмгейтен»), 6 фрегатов («Счастливый», «Рига», «Рафаил», «Венус», «Николай», «Константин»), катер «Диспач» и два транспорта. Кроме них в Англии находились суда Архангелогородской эскадры, сильно пострадавшие от штормов в 1799 г.
В конце мая суда М. К. Макарова, Е. Е. Тета и К.Е. фон Брейера собрались на Портсмутском рейде: На суда начали перевозить русские войска с английских судов. Всего принято 3185 человек. Остальные войска были отправлены в июле на русских и английских судах.
Первой в Россию 5 июня ушла эскадра К.Е. фон Брейера, 25 июня она пришла в Кронштадт.
19 июня остальные суда эскадр под командованием вице-адмиралов М. К. Макарова и Е. Е. Тета покинули Англию и, зайдя в Копенгаген, 9 июля прибыли на Ревельский рейд.
Фрегаты «Рига» и «Константин» были посланы в Ла-Манш для снятия русских войск с островов Гернзей и Жирзней. 19 июня они, придя к островам, сняли 214 русских солдат. 30 июня фрегаты вышли в море, сопровождая английские транспорты с русскими войсками. В начале августа фрегаты пришли в Ревель, а затем – в Кронштадт.
В Портсмуте остались корабль «Европа» – ожидал оставшиеся войска, транспортное судно «Ландфрейнд» для погрузки артиллерии, которую англичане передавали вместо потерянной русскими войсками в Голландии. В Ширнесе для исправления повреждений стояли корабли «Ярослав», «Москва», фрегаты «Феодосий Тотемский», «Рафаил» и в Лите фрегат «Тихвинская Богородица». Все они переданы под командование вице-адмирала Б.А. Баратынского, с предписанием по готовности судов перейти немедленно в Портсмут и посадив войска следовать в Ревель.