Русские и турки заняли все батареи Видо, а затем с боями пробились к центральному редуту. К 12 часам сопротивление гарнизона было сломлено. Попытка французов спастись на шлюпках не имела успеха. Шлюпки были разбиты огнем с кораблей, и до Корфу добралось не более 150 человек. В плен было взято 443 человек, в том числе комендант острова генерал Пиврон. После поднятия на острове Видо флагов союзников был дан сигнал о начале штурма крепости Корфу с суши.
Союзные войска, находившиеся на батареях на острове Корфу, при поддержке десанта (около 900 человек), высаженного с кораблей, стоявших к югу от мыса Сидеро, штурмовали передовые укрепления — форты Сальвадор и Абрам, в то время как корабли продолжали обстрел цитадели. После ожесточенного боя, длившегося до темноты, французы отступили в цитадель. Необычная и очень решительная тактика Ушакова настолько деморализовала гарнизон крепости Корфу, что французское командование, не использовав всех возможностей обороны, 19 февраля вступило в переговоры о капитуляции, которая была подписана 20-го.
По ее условиям войска гарнизона (2931 человек, в т.ч. 4 генерала) отпускались во Францию с условием не участвовать в течение 18 месяцев в военных действиях против государств второй коалиции. На следующий день Ушаков пишет рапорт Павлу I о взятии Корфу.
А.В. Суворов, получив известие о взятии Корфу, воскликнул: «Великий Петр наш жив! Что он, по разбитии в 1714 г. шведского флота при Аландских островах, произнес, а именно: природа произвела Россию только одну: она соперниц не имеет, — то и теперь мы видим! Ура! Русскому флоту!.. Я теперь говорю самому себе: зачем не был я при взятии Корфу хотя мичманом?»
22 февраля корабль «Св. Петр» задержал пришедший к Корфу французский бриг, командир которого не предполагал, что крепость уже взята русскими.
Французский гарнизон Корфу был посажен на суда и отправлен в Тулон. В качестве трофеев были взяты 629 орудий, много оружия и продовольствия. Были захвачены линейный корабль «Леандр», фрегат «Брюн», бомбардирский корабль «Фримёр», поляка «Экспедисьон» (прибывшая в Корфу перед самой капитуляцией), девять гребных судов и, кроме того, три торговых судна, вскоре возвращенных их владельцам. Потери союзников — 299 человек, в том числе русских — 31 убитых и 100 раненых, турок и албанцев — 69 убитых и 99 раненых. При распределении морских трофеев «Леандр» достался русским, «Брюи» — туркам, остальные суда также распределены между союзниками. «Леандр» впоследствии был передан Англии, как бывший английский. Он был отведен в порт Гуви для ремонта.
Занятием крепости Корфу завершилось освобождение Ионических островов. Корфу стал временной базой союзного русско-турецкого флота.
В мае 1799 г. на освобожденных островах была создана Республика Семи Островов. Высшая административная власть в ней принадлежала выборному сенату, состоявшему из делегатов от органов самоуправления, куда избирались представители не только высших классов, но также ремесленников и крестьян. Республика считалась под временным протекторатом России и Турции. Русская военная власть не вмешивалась во внутренние дела островов. Освободив Ионические острова, Россия приобрела на Средиземном море военную базу, которую в дальнейшем очень успешно использовала в ходе войны третьей коалиции европейских держав против Франции.
Г. Нельсон, находившийся в Палермо, 15 февраля направил Ф.Ф. Ушакову письмо с просьбой о присылке части русской эскадры в Мессину для оказания помощи неаполитанскому королевству: «Милостивый государь!
Его сицилийское величество послал письма и доверенное лицо для переговоров с вашим превосходительством о настоящем положении дел в этой стране с просьбой направить часть вашего флота к Мессине для оказания помощи этому королевству, чтобы предотвратить переход его в руки французов, и когда ваше превосходительство получит письмо вашего министра по этому в высшей степени важному делу, то я буду просить вас только об одной очень большой услуге, которую вы можете оказать общему делу, в частности его сицилийскому величеству, а именно послать в Мессину столько кораблей и войск, сколько будет возможно.
Я имею теперь в Египте следующие корабли: «Culloden» 74, «Jealous», «Lion» 64, «Tiqre» 80, «Theseus» 74,«Swiftsure» 74, «Sea Horse» 38, «Etna» и «Veseveus Bombes». При блокаде Мальты — четыре парусных линейных корабля, четыре фрегата и корвета. Я надеюсь в скором времени увидеть флаг его сицилийского величества развевающимся над городом Ла-Валетта. Я имею также два португальских линейных корабля при Мессине и два линейных английских корабля в Палермо.
Имею честь быть с истинным чувством уважения вашего превосходительства покорнейшим слугою».
ПРОРЫВ ФРАНЦУЗОВ В СРЕДИЗЕМНОЕ МОРЕ, ТУРЕЦКИЙ ДЕСАНТ У АБУКИРА, ВОЗВРАЩЕНИЕ БОНАПАРТА ВО ФРАНЦИЮ