Позиции французской армии в Египте были также ослаблены действиями русской эскадры под командованием Ушакова. Овладев в октябре — ноябре 1798 г. Ионическими островами и изгнав оттуда французов, Ушаков лишил их первоклассной средиземноморской позиции для дальнейшего захвата Египта и Константинополя.
В Европе в это время Франция терпела неудачи (в Италии и на Рейне), а внутри ее царили несогласие и упадок духа Вследствие известий об этом и сознания невозможности, из-за потери флота, при настоящих силах армии удержать за собой Египет, Бонапарт решил возвращаться во Францию.
Пользуясь отсутствием у берегов Египта английского флота, Наполеон и сопровождавшие его генералы на двух фрегатах отплыли 23 августа из Египта и, зайдя на Корсику, 9 октября прибыли в Фрежю на побережье Франции.
ДЕЙСТВИЯ РУССКО-ТУРЕЦКИХ ЭСКАДР И ОТРЯДОВ У БЕРЕГОВ ИТАЛИИ
Завершив в феврале 1799 г. освобождение Ионических островов, эскадра Ф.Ф. Ушакова с началом военных действий на суше активно взаимодействовала с союзными войсками.
26 февраля 1799 г. Ф.Ф. Ушаков направил письмо неаполитанскому королю о взятии крепости Корфу и о подготовке к отправке части эскадры в Бриндизи. В тот же день он пишет В.В. Мусину-Пушкину-Брюсу о предполагаемом походе части эскадры в Бриндизи и Отранто, а затем в Мессину.
Ф.Ф. Ушаков сообщил Г. Нельсону о взятии крепости Корфу и о дальнейшем плане действия эскадры: «Ваше превосходительство, милостивый государь!
За почтеннейшие письма вашего превосходительства всепокорнейшее благодарю и известить честь имею: крепости Корфу оружием соединенных эскадр, сильными и решительными действиями взяты нами на договор и нами приняты со всеми укреплениями.
От сего времени отделил я половину эскадры мне вверенной с такой же половиною эскадры Блистательной Порты в разные командировки, и коль скоро получим ожидаемую нами провизию для служителей отправимся в Бриндичи и Отранту для вспоможения и ободрения жителей оных мест, а оттоль, обходя Калабрию, пойдем в Мессину, где надеюсь иметь удовольствие лично засвидетельствовать вашему превосходительству истинное мое почтение и преданность».
2 марта фрегат «Счастливый» (капитан-лейтенант Г.Г. Белли) у Бриндизи взял в плен французский 8-пушечный требакул. Французское судно шло из Анконы в Александрию с депешами генералу Бонапарту.
Англичане неоднократно просили направить часть русских и турецких кораблей к берегам Египта и Сирии, но это разделило бы силы объединенного флота и осложнило бы выполнение основной задачи — освобождения побережья Италии.
5 марта Ф.Ф. Ушаков направил письма Томаре о нежелательности ослаблять силы эскадры посылкой судов к берегам Сирии и Египта по требованию англичан и командующему отрядом английских судов, блокирующих побережье Сирии и Египта, о невозможности прислать из состава соединенной эскадры суда для усиления его отряда.
Русский посланник в Вене князь А.К. Разумовский направил 23 марта 1799 г. письмо Ф.Ф. Ушакову с сообщением просьбы австрийского правительства о выделении части флота для наблюдения за Анконой и охраны морских коммуникаций в Адриатическом море. Днем раньше подобное письмо Разумовский направил А.В. Суворову.
А.В. Суворов написал Ф.Ф. Ушакову: «Здешний чрезвычайный и полномочный посол пишет ко мне письмо, из которого ваше превосходительство изволите ясно усмотреть необходимость крейсирования отряда флота команды вашей на высоте Анконы; как сие для общего блага, то я о сем ваше превосходительство извещаю, отдаю вашему суждению по собранию правил, вам данных, и пребуду с совершенным почтением».
Письмо Г. Нельсона Ф.Ф. Ушакову по случаю взятия Корфу и о выходе английской эскадры для блокады Неаполя 23 марта 1799 г.: «С усердием поздравляю ваше превосходительство с победою Корфы, уверяю вас, что слава оружия верного союзника столь же для меня лестна, как и слава моего государя. Я имею великую надежду, что Мальта весьма в скором времени покорится действиям, производимым против оного острова. Флаг его сицилийского величества, равно и великобританский, поднят во всех частях острова, выключая города Ла-Валетта, жители коего с дозволения его сицилианского величества предались под покровительство Великобритании. Завтрашний день отправляется эскадра для блокады Неаполя, которая продолжится с неусыпным старанием до прибытия вашего превосходительства с войсками его величества вашего государя, кои, я не сомневаюсь, восстановят его сицилианское величество на троне. Производя сие доброе дело, за удовольствие почту содействовать с вами дружелюбно и уверить вас лично, сколько я чувствую себя вашего превосходительства и проч.».