Отряд 8 мая подошел к городу Манфредония. Здесь к А.А. Сорокину прибыла депутация города Фаджио с просьбой освободить город от французов. На военном совете, в котором принял участие и А. Мишеру, решено было отправить на берег десант в количестве около 500 матросов при четырех орудиях. Его возглавил командир фрегата «Счастливый» капитан-лейтенант Г.Г. Белли. Заняв фалжио, десант начал поход вглубь страны. Хотя к этому времени большая часть побережья была уже в руках неаполитанского короля, столицу королевства Неаполь все еще занимали французы. Десанту предстоял небывалый по сложности поход на Неаполь. 12 мая в поход выступил авангард — 120 матросов с двумя пушками. Через одиннадцать дней — остальные.
Десант Г.Г. Белли (получивший подкрепление из Барлетты — 100 матросов и две пушки с фрегата «Григорий Великия Армении») 25 мая в Ариано соединился с ополчением кардинала Руффо.
29 мая войска выступили к Неаполю. Авангардом командовал Белли. 2 июня войска Белли и Руффо заняли Портичи и подошли к Неаполю. Один за другим перед ними сложили оружие гарнизоны трех фортов. Теперь впереди была река Себето. Через реку вел мост Святой Магдалины. Его прикрывала 6-орудийная батарея и бригада генерала Виртцема (2 тысячи). На фланге находилась флотилия итальянского республиканца Карачиолло. Русские с ходу начали бой, их пушки открыли сосредоточенный огонь по французской батарее. Моряки-канониры быстро сбили все шесть пушек, затем потопили два судна, а остальные отошли. Ободренные успехом матросы бросились в штыки.
3 июня Белли штурмовал уже самый Неаполь. В эти же дни кардинал Руффо со своим ополчением вступил в Неаполь, и к вечеру 4 июня почти вся столица была в руках роялистов. Засевшие в пригородах республиканцы после попытки к сопротивлению принуждены были заключить 9 июня перемирие на три дня, для выработки условий капитуляции. 12-го числа капитуляция уже была подписана на довольно выгодных для республиканцев условиях, на что имели свои основания согласиться и Белли и Руффо и английский представитель.
Когда Павел I получил донесение о взятии Неаполя десантом капитан-лейтенантом Г.Г. Белли, он с радостью воскликнул: «Белли думал меня удивить, так и я его удивлю!» и пожаловал капитан-лейтенанту орден Св. Анны 1-й степени, полагавшийся по статуту только отличившимся генералам.
13 июня к Неаполю подошла эскадра Г. Нельсона Узнав о мягких условиях капитуляции, британский адмирал объявил их недействительными. Начались жестокие репрессии против сторонников республики. Русские тщетно пытались смягчить террор. В июле капитулировали осажденные союзниками Капуа и Гаэта По приказу Ф.Ф. Ушакова отряд А.А. Сорокина вернулся в Корфу.
ЭСКАДРЫ П.В. ПУСТОШКИНА И Н.Д. ВОЙНОВИЧА У АНКОНЫ, ВЗЯТИЕ АНКОНЫ
По просьбе А.В. Суворова и австрийского правительства Ф.Ф. Ушаков, почти одновременно с отрядом А.А. Сорокина, отправил эскадру контр-адмирала П.В. Пустошкина в Адриатическое море для блокады Анконы. О посылке этой эскадры Ф.Ф. Ушаков сообщил А.В. Суворову.
Порт и крепость Анкона была важной базой французов. Отсюда их суда осуществляли контроль над всей северной Адриатикой и затрудняли снабжение итальянских войск из австрийских портов.
На укреплениях и батареях крепости Анкона стояло до 700 орудий, гарнизон крепости состоял из трех тысяч человек под командованием генерала Монье. В 1799 г. в Анконе базировались четыре линейных корабля, вспомогательные суда и 8 — 10 каперских судов. Порт Пантелагоскуро в низовьях реки По, защищенный с юга и запада крепостями Феррара и Мантуя, использовался для укрытия каперской флотилии (350 лодок). В начале 1799 г. морские сообщения австрийцев были нарушены в результате действий каперов, от набегов которых сильно страдало побережье Далмации.
1 мая русские линейные корабли «Св. Михаил», «Симеон и Анна», фрегаты «Богородица Казанская» и «Навархия», бригантина и судно «Красноселье», а также турецкие: корабль, два фрегата, корвет и тартана снялись с рейда Корфу и пошли к Анконе.
Суда отряда 7 мая пришли на вид Анконы и блокировали крепость. Предложение о сдаче французы отклонили, союзные суда начали бомбардировку крепости.
С 12 по 27 мая блокада прерывалась, так как корабли уходили к берегам Исгрии за пресной водой и провиантом 27 мая корабли вновь пришли к Анконе. 2 июня десантом был взят город Фано. 7 июня десант в 200 человек овладел крепостью Сенигаллия вблизи Анконы. Эскадра П.В. Пустошкина уничтожила или изгнала с моря итальянских и французских каперов, грабивших торговые суда всех национальностей.
П.В. Пустошкин готовился к решительным действиям против Анконы, но 10 июня был отозван в Корфу, куда Ушаков стягивал все свои корабли, так как в Средиземном море появилась Брестская эскадра, и Нельсон, опасаясь решительных действий со стороны адмирала Брюи, просил о соединении русских и английских сил у Палермо. В связи с этим сам Г. Нельсон снял блокаду Мальты. 22 июня эскадра П.В. Пустошкина прибыла в Корфу и соединилась с эскадрой Ф.Ф. Ушакова.