Новое волнение в Новгороде произошло в 1257 году. Оно было вызвано появлением на Руси татарских «численников» — переписчиков населения, которые были присланы из Орды для более точного обложения населения данью. Русские люди того времени относились к переписи с мистическим ужасом, видя в ней знак Антихриста — предвестие последних времен и Страшного суда. Целый год в Новгороде продолжались волнения. На стороне горожан оказался даже сын Александра князь Василий. При появлении отца, сопровождавшего татар, он бежал в Псков. На этот раз новгородцы избежали переписи, ограничившись выплатой богатой дани татарам. Но их отказ исполнить ордынскую волю вызвал гнев великого князя. Василий был сослан в Суздаль, зачинщики беспорядков жестоко наказаны: одних, по приказанию Александра, казнили, другим «урезали» нос, третьих ослепили. Лишь зимой 1259 года новгородцы, наконец, согласились «дать число». Тем не менее появление татарских чиновников вызвало в городе новый мятеж. Лишь при личном участии Александра и под защитой княжеской дружины перепись была проведена. «И начали окаянные ездить по улицам, переписывая дома христианские», сообщает новгородский летописец. После окончания переписи и отъезда татар Александр покинул Новгород, оставив в нем князем малолетнего сына Дмитрия.
В 1262 году Александр послал большое войско под номинальным командованием своего сына Дмитрия против Ливонского ордена. Этот поход завершился крупной победой — был взят город Юрьев (Тарту). Сам Александр в том же году в четвертый (и последний) раз отправился в Орду. «Было в те времена насилие великое от иноверных, — рассказывает княжеское Житие о цели его поездки, — гнали они христиан, заставляя их воевать на своей стороне. Князь же великий Александр пошел к царю (хану. —
Александру, очевидно, удалось достичь своих целей. Однако хан Берке задержал его почти на год. Лишь осенью 1263 года, уже больной, Александр вернулся на Русь. Добравшись до Нижнего Новгорода, князь совсем занемог. В Городце на Волге, уже чувствуя приближение смерти, Александр принял монашеский постриг (согласно поздним источникам, с именем Алексея) и 14 ноября скончался. Тело его перевезли во Владимир и 23 ноября похоронили во Владимирском Рождественском соборе при огромном стечении народа. Известны слова, которыми митрополит Кирилл возвестил народу о кончине великого князя: «Дети мои, знайте, что уже зашло солнце земли Суздальской!»
Житие рассказывает о чуде, случившемся при погребении святого. «Когда было положено святое тело его в гробницу, тогда Севастьян-эконом и Кирилл-митрополит хотели разжать его руку, чтобы вложить грамоту духовную. Он же, будто живой, простер руку свою и принял грамоту из руки митрополита. Так прославил Бог угодника своего».
Уже в XIII веке князь был причтен Церковью к лику святых. (Общероссийское празднование святому было установлено на церковном соборе 1547 года, который проходил под председательством митрополита Макария.) Поздние редакции Жития повествуют о многочисленных чудесах, совершавшихся у его гробницы. В 1724 году был установлен и новый праздник — в честь перенесения мощей святого князя.
Инициатором перенесения мощей стал император Петр Великий. На берегах Невы — там, где прославилось некогда имя Александра Невского, им были одержаны новые блестящие победы над шведами. В 1703 году здесь была заложена и новая столица России — Санкт-Петербург, а в 1717 году — и новая российская святыня — Александро-Невская лавра. Император Петр желал перенести сюда из Владимира мощи святого князя Александра Невского. Войны со шведами и турками замедлили исполнение этого желания, и только в 1723 году приступили к его исполнению. 11 августа со всей подобающей торжественностью святые мощи вынесли из Рождественского монастыря; процессия направилась к Москве, а затем к Санкт-Петербургу. По замыслу Петра в новую столицу России святые мощи предполагалось внести 30 августа — в день заключения со шведами Ништадтского мира (1721 год). Однако дальность пути не дала осуществить этот план, и мощи прибыли в Шлиссельбург только 1 октября. По распоряжению императора они были оставлены в шлиссельбургской церкви Благовещения, а перенесение их в Санкт-Петербург отложено до следующего года.