Многие пестициды неспецифичны — они убивают всех подряд насекомых. Отрицательный эффект от применения пестицидов связан с тем, что они уничтожают не только вредных насекомых, но и их естественных врагов (сверхпаразитов). Поэтому разрушаются механизмы, при помощи которых численность вредителей в биогеоценозах поддерживалась на определенном, обычно низком, уровне. А если у насекомых, кроме того, вырабатывается устойчивость к пестициду, то после его использования наступает неожиданная вспышка — массовое размножение вредителя, так как механизмы, сдерживающие его развитие, подавляются. Примером могут служить тетраниховые клещи. До применения пестицидов они встречались редко, а в настоящее время на борьбу с ними расходуют около половины производимых пестицидов (Рубцов).
Загрязнение сельскохозяйственных экосистем радионуклидами при авариях атомных электростанций — еще один пример нежелательного побочного эффекта развития ядерной физики и внедрения научных достижений в производство (в энергетику). Долгоживущие радионуклиды, как и стойкие пестициды, распространились по всей биосфере. Поэтому заложниками радиоактивных загрязнений стали не только растительные и животные организмы, но и человек.
Отрицательные последствия дает и загрязнение сельскохозяйственных экосистем металлическим мусором. Высокоразвитые промышленные страны производят множество различных металлических изделий. Часть из них предназначается для сельского хозяйства. Десятки тракторов, плугов, борон, сеялок, культиваторов, комбайнов, жаток, подборщиков, молотилок, автопоилок, доильных агрегатов, различных устройств и приспособлений, сотни метров труб, проволоки, огромное количество гвоздей, скоб, крепителей — неполный перечень того, что поступает во многие сельскохозяйственные экосистемы (Новошинов). Эксплуатация приборов, механизмов, машин, различных устройств ограничена временем вследствие их износа, устаревания и порчи. Металлолом частично возвращается в плавильные печи и перерабатывается, а другая его часть теряется, загрязняя среду.
В хозяйствах, где поля, луга, пастбища, склады фуража и корма, животноводческие помещения и прифермские территории загрязнены кусками проволоки, гвоздями и другими остроконечными предметами, у крупного рогатого скота развивается тяжелая болезнь травматический ретикулит, суть которой состоит в травматическом повреждении сетки. Очень быстрое, неразборчивое поедание корма, недостаточное его пережевывание способствуют попаданию инородных тел в ротовую полость животных. Инородные предметы проглатываются и попадают в преджелудки. В момент сокращения сетки они могут повреждать ткани, перфорировать стенку органа. В. Я. Никитин показал, что негативные антропогенные изменения в природе — основная причина бесплодия сельскохозяйственных животных.
Все многочисленные антропогенные факторы можно объединить в четыре группы (Лаптев).
1. Факторы-тела: почвы, рельеф, водоемы, здания, растения, животные и пр. Как правило, факторы-тела неподвижны, например курганы. Интродуцированные растения и животные представляют исключение. Многие из факторов-тел существуют давно, например почвы, озера.
2. Факторы-вещества: химические элементы, радиоактивные вещества, выбросы предприятий и т. д. Факторы-вещества не ограничены пространством, степенью концентрации: одни из них быстро разрушаются, другие находятся в природе, не изменяясь длительное время — десятки, сотни, тысячи лет.
3. Факторы-процессы: вспашка почвы, коррозия металлов, перемещение растений и животных и т. д. Факторы-процессы обладают большой динамичностью.
4. Факторы-явления: загрязнения воздуха, воды, почв, радиоволны, электрический ток и т. д. Их действие пространственно ограничено, при увеличении расстояния от источника загрязнения они исчезают.
Факторы среды (физические, химические, биотические, информационные и иные) действуют на организмы не изолированно, а в сочетании и во взаимодействии друг с другом.
Множество элементарных биогеоценотических компонентов, процессов, явлений формируют окружающую среду. Окружающая среда, т. е. среда жизни для растений и животных, — это совокупность разнообразных экологических факторов, их определенные комбинации. Для каждого типа биогеоценоза, тундрового или таежного, степного или какого-то иного, характерна комбинация взаимосвязанных экологических факторов. Биогеоценозы разных типов легко отличаются друг от друга по ряду признаков, в том числе по комплексу экологических факторов, находящихся в определенных соотношениях и сочетаниях. Так, например, для тундровых биогеоценозов характерно сочетание низкой температуры с высокой влажностью, а в пустынных БГЦ, наоборот, высокая температура сочетается с низкой влажностью.