В интервью от 26.01.2004 года, отвечая на вопросы газеты Neue Zuercher Zeitung, новоизбранный президент подчеркнул, что
В середине июля 2006 года парламент Грузии принял резолюцию, в которой в ультимативной форме было выражено требование вывода российских миротворческих сил из Абхазии и Южной Осетии. В ответ на это парламент Абхазии призвал все страны, в том числе Россию,
Руководитель МИД РФ Сергей Лавров 20 июля в интервью газете «Коммерсант» заявил:
В конце июля 2006 года президент Грузии Михаил Саакашвили отменил свой визит в Москву для участия в неформальном саммите СНГ в связи с отказом российской стороны организовать его встречу с Владимиром Путиным.
А 25 июля подразделения грузинских вооруженных сил и МВД (до 1,5 тысячи человек) были введены в Кодорское ущелье. Формально — для проведения спецоперации против местных вооруженных сванских формирований (батальона «Монадире») Эмзара Квициани, отказавшегося подчиниться требованию министра обороны Грузии Окруашвили сложить оружие и обвиненного в «измене родине».
За короткий срок Грузия восстановила контроль над Кодорским ущельем. 27 сентября 2006 года, в День памяти и скорби, указом президента Грузии Саакашвили район Кодори был переименован в Верхнюю Абхазию, что фактически означало новый виток конфликта.
Посетив Кодорское ущелье, Саакашвили заявил, что нынешняя Грузия сильно отличается от Грузии времен Эдуарда Шеварднадзе и готова ответить всем, кто покусится на ее территориальную целостность:
В селе Чхалта на территории ущелья было размещено так называемое законное правительство Абхазии в изгнании. В нескольких километрах от этого села дислоцированы абхазские военные формирования, подконтрольные Сухуми.
Тем временем 18 октября 2006 года Народное собрание Абхазии обратилось к российскому руководству с просьбой признать независимость республики и установить между двумя государствами ассоциированные отношения, однако на тот момент ответа не получило.