Бывало такое, что бесы, все более озлобляясь на подвижника, поднимали отца Серафима на воздух и с такой силой бросали его на пол, что не могло остаться ни одной целой кости, если бы не охраняла подвижника благодать Божия. Можно думать, что отец Серафим видел самих злых духов. На простосердечные вопросы некоторых мирян об этом батюшка отвечал: «Они гнусны. Как на свет ангела взглянуть грешному человеку невозможно, так и бесов видеть ужасно, потому что они очень уж гнусны».
Во всех искушениях и нападениях на отца Серафима диавол имел одну цель — удалить его из пустыни. Попытки оказались безуспешными, враг отступил, но в покое не оставил, придумывая новые козни…
Другие пустынножители имели при себе по одному ученику, которые и служили им. Отец Серафим жил в совершенном одиночестве. (Только представьте себе — в лесной чаще, населенной дикими зверями, без электричества и телефона — на дворе XVIII век.) Некоторые из саровской братии пытались сожительствовать с отцом Серафимом в пустыни и были приняты им, но ни один из них не смог вынести трудностей пустыннического жития, ни в ком не нашлось столько мужества и духовной крепости, чтобы стать подражателем подвигов старца и его учеником.
В начале своего поселения в пустыни отец Серафим питался хлебом, который он брал из монастыря на целую неделю. Из этой малой порции он уделял еще долю животным и птицам, приласканным старцем. Они любили его и приходили на место его молитвословий. Много раз видели, как он из рук кормил огромного медведя, свирепого на вид, но становившегося кротким, как ягненок, при виде старца. Потом отец Серафим отказался даже и от хлеба насущного, питался только овощами со своего огорода. Два с половиной года старец вообще не брал хлеба из обители.
Духовное начальство понимало, как полезно было бы для многих сделать такого мудрого подвижника, как отец Серафим, а в в о й (отцом) настоятелем в какой-нибудь обители. Открылась вакансия в Алатырском монастыре. Отца Серафима предназначили было туда настоятелем с возведением в сан архимандрита. Но он стал убедительно просить отклонить от него назначение. Настоятелю Исайе и всей братии было очень жаль отпускать отца Серафима, усердного молитвенника и мудрого наставника. К радости обеих сторон, другой старец принял на себя тяжелое бремя настоятельства в чужом монастыре. Чуть позже предоставилась новая возможность сделать карьеру «по духовной линии», но батюшка наотрез отказался, и более ему того не предлагали.
12 сентября 1804 года подошли к старцу, рубившему дрова, три неизвестных крестьянина и дерзко потребовали от него денег, говоря, что «к тебе ходят мирские люди и деньги носят». Отец Серафим отвечал, что денег не берет. Не поверив ему, крестьяне напали на монаха. Один, кинувшись на него сзади, вдруг сам упал и оробел, но двое других не отступились. У отца Серафима в руках был топор, он был очень силен физически и вполне мог рассчитывать, что отобьется от злодеев. Подвижник уже замахнулся, но вспомнил слова Христовы: «Все, взявшие меч, от меча и погибнут». Тогда он опустил топор, сложил на груди крестообразно руки и сказал: «Делайте, что вам надобно».
Один из злодеев, схватив топор, обухом ударил страдальца по голове, так что у него из ушей и изо рта хлынула кровь, и старец упал в беспамятстве. Тогда крестьяне потащили его в келью, продолжая избивать, и даже хотели бросить в реку. Но когда увидели, что он точно мертвый, связали по рукам и ногам и бросили в сенях, а сами обшарили все углы в келье, сломали печь, надеясь отыскать деньги. Но ничего не нашли у старца: видели только святую икону и несколько картофелин. На разбойников вдруг напал страх, и они убежали.
Когда отец Серафим пришел в себя, то с невероятным трудом выпутался из веревок, помолился Богу об обидчиках и на другой день приплелся в монастырь в самом ужасном виде: волосы на голове и на бороде в запекшейся крови и грязи, выбито несколько зубов, череп проломлен, несколько ребер сломано, вся одежда в крови. Братия ужаснулась, но он никому ничего не стал рассказывать, кроме настоятеля и монастырского духовника.
Первые восемь дней страдания его были чрезвычайно сильны. Батюшка не мог ни есть, ни пить, ни на минуту забыться сном от нестерпимой боли. С минуты на минуту ожидали его смерти. На седьмой день болезни, не видя улучшения, настоятель послал за врачом в Арзамас. Приехали три врача и три фельдшера, осмотрели больного и были чрезвычайно удивлены, что старец еще жив при нескольких смертельных ранах. Они стали советоваться над постелью больного по-латыни, что предпринять.
Тем временем отец Серафим вдруг забылся во сне, и ему было новое видение. К его постели подошла окруженная славой в царской порфире Пресвятая Богородица с апостолами Петром и Иоанном Богословом. Она, обратясь Своим ликом в сторону врачей, произнесла: «Что вы трудитесь?» А затем, указывая апостолам на подвижника, сказала, как это уже было: «Сей от рода нашего».