Летописи не могли обойти молчанием кончину Сергия. «Тое же осени преставися преподобный игумен Сергий, святый старец, чудный, добрый, тихий, кроткий, смиренный; просто и не умею его жития сказати ни написати. Но токмо знаю, прежде его в нашей земле такового не бывало. Всеми человеки любим бысть честнаго ради жития его, иже бысть пастух не токмо своему стаду, но всей русской земли нашей учитель и наставник».
И после того как Сергий отошел в мир иной, он не оставил своим попечением обитель и всю русскую землю. Множество чудес и исцелений совершалось там, где пребывала душа преподобного. Люди продолжали идти к радонежскому старцу за советом, утешением, веря, что он знает их нужды и обязательно поможет в беде.
Являясь в видениях немногим своим избранникам, святой старец предсказывал некоторые события. Его предсказания всегда сбывались. В 1408 году пронесся слух о том, что большая татарская рать снова двинулась на Москву. Люди в ужасе разбегались, бросая свои дома. Игумен Святотроицкой обители Никон не знал, покидать ли ему с братией монастырь или остаться? Ведь отряды Тохтамыша так и не смогли добраться в глушь Радонежских лесов.
Никон усердно молился, прося Господа о защите. Призывал он и преподобного Сергия дать ему совет и вразумление. Не мог игумен и помыслить, что погибнет плод многолетних трудов святого старца и будет поругано и опустошено место, освященное его подвигами, и поколеблется вера немощных торжеством неверных.
Поздно ночью Никон присел отдохнуть после молитвы, и тут в «тонком сне» явились ему святители Петр и Алексий и с ними преподобный Сергий, который сказал ему: «Господу угодно, чтобы нашествие иноплеменников коснулось и сего места. Но ты, чадо, не скорби и мужайся: искушение будет непродолжительно, обитель не запустеет, а еще более процветет».
После этих слов пришедшие стали невидимы. А Никон только через какое-то время пришел в себя. Дверь его кельи оказалась запертою. Он подумал, что все это ему приснилось. Но когда отпер дверь и вышел на крыльцо, то увидел, как святые медленно шествовали от кельи к церкви. Никон удостоверился, что это было истинное видение, а не сон.
Предсказание Сергия вскоре исполнилось. Татары под предводительством хана Едигея разорили и сожгли обитель. Но предупрежденные старцем иноки вовремя удалились, спасая ценные книги, монастырские святыни, деревянные сосуды и келейные вещи преподобного, которые и поныне хранятся в лавре.
Вскоре братия вернулись на родное пепелище, и через три года обитель была отстроена заново. Новый деревянный храм Пресвятой Троицы был освещен 25 сентября 1412 года, в день памяти святого старца. И многие достойные видели, как преподобный Сергий со святителем Алексием приходили освящать новые здания обители.
По прошествии тридцати лет со дня кончины Сергия Радонежского преподобный явился одному доброму христианину, большому почитателю святого старца, жившему недалеко от Святотроицкой обители, и велел сказать игумену и братии: зачем так долго оставляют его в земле, где «вода утесняет» тело его?
5 июля 1422 года в обители состоялось торжественное обретение мощей преподобного. Весть об этом задолго до намеченного дня разнеслась по русской земле. Присутствовать при знаменательном событии пожелали многие духовные лица из монастырей, ученики Сергия и простые иноки. Приехали и князья, среди них крестный сын Сергия Юрий Дмитриевич, брат великого князя Василия Дмитриевича.
В присутствии многочисленных паломников, священников и князей гроб с телом преподобного Сергия был извлечен из земли и открыты нетленные его мощи. Всех присутствующих поразило, что не только тело святого «цело и светло соблюдеся, но и одежда его, в ней же погребен бысть, цело бяше всяко и тлению никакоже сопричастна», хотя гроб стоял в воде.
На время мощи чудотворца были помещены в деревянной церкви. А на том месте, где тридцать лет покоился Сергий, началось строительство первого каменного храма. Над росписью Троицкого собора трудились знаменитые иконописцы Даниил Черный и Андрей Рублев. При освящении нового собора святые мощи преподобного были перенесены в него.
С этого времени в монастыре началось ежегодное празднование памяти преподобного Сергия в день его преставления 25 сентября. А тридцать лет спустя после обретения мощей митрополитом Ионою Сергий был причислен к лику всероссийских святых, которых в то время было еще очень немного. И в 1463 году в Новгороде была построена первая церковь во имя преподобного Сергия.
Праведники живут вовеки, говорится в Писании. Вот уже шесть веков идут верующие к мощам радонежского чудотворца как к величайшей святыне. Или молятся ему за сотни, тысячи верст от лавры: «Преподобие отче Сергие, моли Бога о нас». И все просящие получают помощь: больные — здравие, скорбящие — облегчение и успокоение, бедствующие — помощь и заступление, гонимые — защиту.