Конфликт зрел годами, и в основе его был земельный вопрос. Очень быстро обнаружились русские провокаторы. Не турецкие, а русские! Переселенческая политика велась за счет коренных народов. У них отбирали землю и отдавали пришлым. Ее все равно не хватало. И кто-то из переселенцев подумал: сейчас туземцы взбунтуются, власть их накажет, конфискует наделы и отдаст нам. Поэтому щепки в костер бросали с разных сторон.
Разумеется, не упустили такой шанс религиозные фанатики и турецко-германские шпионы. Они сразу начали распространять слух, что мусульман забирают не для того, чтобы рыть окопы в тылу. Их выманят из родных мест, а там бросят под пули. Цель власти неверных — убить всех мусульман, а их земли передать русским. В условиях многолетней колонизации, при отсутствии внятных объяснений из центра это казалось правдоподобным. И начался кровавый бунт.
Первые волнения вспыхнули в Ходженте 3 июля, 7 июля перекинулись на Ташкент. 13-го в Джизаке убили уездного начальника полковника Рукина. 18 июля Туркестан был объявлен на военном положении, генерал-губернатором стал Куропаткин.
Восстание в Ферганской долине было подавлено быстро. Немалую роль сыграла беспощадная карательная экспедиция в Джизак. Земли местных жителей Куропаткин в наказание объявил конфискованными. Оседлое население проще покорить. Но вскоре возмутились кочевники, и восстание приняло много больший размах.
С обеих сторон были отмечены случаи чудовищной жестокости. Счеты к русским, которые копились десятилетиями, были предъявлены. Особенно много крови пролилось в киргизских волостях Семиречья. Верный оказался в осаде. Села переселенцев и казачьи станицы подвергались нападениям. Например, в селе Кольцовка из 650 жителей в живых осталось 35. В отместку поселенцы начали убивать мусульман. В Беловодье армия собрала пленных киргизов, а гражданские набросились на них с вилами и топорами, перебив 517 человек. Уцелевших повели в Пишпекскую тюрьму, но закололи по дороге… Когда русские солдаты входили в сожженные деревни и видели растерзанные трупы женщин и детей, они отвечали такими же зверствами. И уже нельзя было вспомнить, кто начал первым…
К восстанию присоединились и другие народы. В селении Аксу киргизы ограбили и убили до полутысячи кашгарцев. А в Пржевальске русские отомстили дунганам за зверскую жестокость в отношении православных: из полутора тысяч дунган уцелело лишь восемь человек.
Казахи не остались в стороне, тем более что сохранившаяся у них племенная основа позволяла быстро собрать большие силы. Город Тургай осадили повстанцы под командованием Амангельды Иманова и Абдугаппара Жанбосынова. Они выдерживали бои с армейскими подразделениями до февраля 1917 года.
Тогда же Куропаткин подвел итоги кровавых событий. По сообщенным им в Петроград официальным данным, в одной только Семиреченской области погибло 2325 русских и 1384 пропало без вести. Сколько при этом погибло мусульман, историки спорят до сих пор. Точного учета коренного населения налажено не было. А многие казахские аулы откочевали в Китайский Туркестан. Но, судя по всему, счет погибшим превысил сто тысяч. Большая часть этих жизней формально не на совести русских солдат. Люди ушли зимой в горы, неподготовленные, без припасов. Скот пал. В Китае никто не ждал новых поселенцев, для них не было ни свободной земли, ни занятий. Кочевые калмыки, например, первым делом обобрали пришлецов. А когда пропал скот, начали умирать и люди.
В Тургае казахские представители во главе с Алиханом Букейхановым с согласия губернатора пытались примирить стороны. Они предложили временно приостановить призыв, уточнить списки, оставить в каждой семье не менее одного работника, освободить от работ мулл и учителей. Все эти разумные меры не были приняты властями.
В конце концов восстание 1916 года было подавлено армейскими частями при участии переселенцев. Случившееся обратили против туземцев и в наказание конфисковали земли бежавших в Китай. Но планам перелицевать карту наделов помешал февраль 1917 года. Временное правительство объявило амнистию для участников восстания, и бежавшие в Китай могли бы вернуться. Однако это оказалось непросто. Например, русское население Пржевальского уезда было категорически против возвращения дунган села Мариинского. Те замарали себя во время мятежа особыми зверствами, и власти опасались новой вспышки насилия…
Как бы то ни было, Февральская революция остановила взаимное истребление. В июле 1917 года на Первом Всеказахском съезде была основана партия Алаш. Она ставила задачей добиться автономии казахов. Лидеры партии прежде были кадетами, и стояли за демократические ценности. Они предложили объединить в национальную автономию все земли, на которых казахское население является господствующим. Остальным народностям гарантировались права меньшинства. Автономия должна была войти в Российскую демократическую федеративную республику на равных с другими.